Table 3.
SNPs in |
|||||||||||||
Patient and Exon or Intron of COL17A1 | Nucleotide Position | Blood | Upper Arm | Middle Finger | Forearm | Ankle | Handa | ||||||
Patient 1: | |||||||||||||
Intron 19 | 1822+14 | T | C | T | C | T | C | … | … | … | … | … | … |
Intron 28 | 2268+120 | T | C | T | C | T | C | … | … | … | … | … | … |
Exon 51 |
3781 |
C | T |
C | C | C | T |
… | … | … | … | … | … |
Exon 52 | 4214 | G | A | G | A | G | A | … | … | … | … | … | … |
Exon 54 |
4424–4425 |
insC |
… | insC |
… | insC |
… | … | … | … | … | … | … |
Intron 54 | 4463-1 | G | G | G | G | A | G | … | … | … | … | … | … |
Patient 2: | |||||||||||||
Exon 18 |
1706 |
A | del |
A | A | … | … | A | A | A | del |
A | A |
Intron 19 | 1822+14 | C | T | C | C | … | … | C | C | C | T | C | T |
Intron 28 | 2268+120 | C | T | C | T | … | … | C | T | C | T | C | T |
Exon 37 | 2700 | T | C | T | C | … | … | T | C | T | C | T | C |
Exon 43 | 2988 | A | C | A | C | … | … | A | C | A | C | A | C |
Exon 51 |
3781 |
T |
C | T |
C | … | … | T |
C | T |
C | T |
C |
Exon 51 | 3782 | G | G | G | G | … | … | G | G | C | G | G | G |
Note.— SNPs within the COL17A1 gene are indicated by nucleotides. The pathogenic mutations are underlined, and the compensatory second-site mutations are in bold italics.
Data for the hand were obtained from Jonkman et al. (1997).