Table 1.
M type | Size of PCR product (bp) | Size of restriction fragment (bp) | No. (%) of isolates from PCR-RFLP analysis | M type | Size of PCR product (bp) | Size of restriction fragment (bp) | No. (%) of isolates from PCR-RFLP analysis |
M1 | 1071 | 354 | 16 (15.09%) | M49 | 450 | 336 | 2 (1.89%) |
892 | 257 | 252 | |||||
744 | 218 | 196 | |||||
592 | 147 | 135 | |||||
110 | 89 | ||||||
87 | Emm58.5 | 545 | 370 | 1 (0.94%) | |||
47 | 185 | ||||||
37 | M66 | 566 | 252 | 1 (0.94%) | |||
29 | 450 | 206 | |||||
M4 | 747 | 314 | 2 (1.89%) | 148 | |||
609 | 174 | 123 | |||||
476 | 57 | M81 | 649 | 322 | 7 (6.60%) | ||
47 | 493 | 185 | |||||
M11 | 710 | 593 | 8 (7.55%) | 375 | 127 | ||
592 | 434 | 84 | |||||
450 | 147 | 62 | |||||
117 | M89 | 404 | 350 | 1 (0.94%) | |||
M12 | 1121 | 349 | 3 (2.83%) | 77 | |||
116 | M93 | 679 | 254 | 22 (20.75%) | |||
93 | 540 | 227 | |||||
78 | 411 | 168 | |||||
59 | 130 | ||||||
51 | 93 | ||||||
M25 | 649 | 247 | 10 (9.43%) | 53 | |||
540 | 203 | M102 | 420 | 332 | 1 (0.94%) | ||
148 | 92 | ||||||
51 | M104 | 450 | 210 | 3 (2.83%) | |||
37 | 146 | ||||||
M33 | 812 | 347 | 3 (2.83%) | 118 | |||
670 | 168 | M109 | 509 | 386 | 3 (2.83%) | ||
541 | 94 | 168 | |||||
74 | M112 | 450 | 435 | 5 (4.72%) | |||
M44/61 | 450 | 212 | 11 (10.38%) | 104 | |||
133 | st11014 | 744 | 596 | 5 (4.72%) | |||
M48 | 710 | 162 | 2 (1.89%) | 620 | 87 | ||
592 | 121 | 493 | 29 | ||||
471 | 81 |