TABLE 1.
Isolate | Species (identified by species-specific PCR primers) | Species identification confirmed by 16S rDNA sequence | Identification by transaldolase (migration in DGGE) |
---|---|---|---|
A6a | B. longum | NDa | B. longum I |
HB2 B-1 | B. longum | ND | B. longum I |
NH1-B2 | B. longum | ND | B. longum I |
GT10-1C | B. longum | B. longum | B. longum I |
JBA1 B-1 | B. longum | ND | B. longum I |
MH B-1 | B. longum | B. longum | B. longum II |
GT9 T-1C | B. adolescentis | ND | B. adolescentis I |
GT FOS1 | B. adolescentis | B. adolescentis | B. adolescentis I |
GT FOS8 | B. adolescentis | B. adolescentis | B. adolescentis I |
MH2 B-10 | B. adolescentis | ND | B. adolescentis I |
MH2 B-2 | B. adolescentis | ND | B. adolescentis I |
HB2 B-3 | B. adolescentis | ND | B. adolescentis I |
A12 | B. adolescentis | B. adolescentis | B. adolescentis II |
A15 | B. adolescentis | B. adolescentis | B. adolescentis III |
JB1 B-1 | B. adolescentis | ND | B. adolescentis IV |
KB1 | B. adolescentis | ND | B. adolescentis IV |
ALM2 B-2 | B. adolescentis | ND | B. adolescentis IV |
HB1 B-5 | B. adolescentis | B. adolescentis | B. adolescentis IV |
JB4 T-1C | B. adolescentis | ND | B. adolescentis IV |
G1 | B. adolescentis | B. adolescentis | B. adolescentis IV |
NH2 B-5 | B. adolescentis | B. adolescentis | B. adolescentis V |
G2 | B. catenulatum group | B. pseudocatenulatum | B. pseudocatenulatum I |
NH1 B-4 | B. catenulatum group | B. pseudocatenulatum | B. pseudocatenulatum I |
G4 | B. catenulatum group | B. pseudocatenulatum | B. pseudocatenulatum II |
G3 | B. catenulatum group | B. pseudocatenulatum | B. pseudocatenulatum II |
G3a | B. catenulatum group | B. pseudocatenulatum | B. pseudocatenulatum II |
JB FOS5 | B. bifidum | ND | B. bifidum |
ND, not done.