Table 3.
Native American Haplogroups and HV1 Sequence Variation Observed for Individuals of North-Central Mexico
| Variable Nucleotide Position |
|
| 11111111111111111111111111111111111111111111111116666666666666666666666666666666666666666666666666001111111111111222222222222222222233333333333333359112224677888801122233344567779990001122234556661213679542617894782383491866048048149193575267025 | |
| Reference Sequencea | ATCATAGGATCACCTGTCCCCACCACCCCGCCCTCTATGTTCATTTCTC |
| Haplogroup A: | |
| C1 | ..T................T.........A.T......A......C.C. |
| 524I | ...................T.........A.T......A........C. |
| C68 | ..TT...............T.........A.T......A........C. |
| C70 | ..T................T.........A.T......A........C. |
| D36 | ..T................T.........A.T......A........C. |
| D37 | ..T................T.........A.T......A........C. |
| O8 | ..T...........C....T.........A.T......A........C. |
| P13 | ..T................T..TT.......TT.....A........C. |
| P9 | ..T................T...T.......T......A........C. |
| P4 | ..T................T...........T......A........C. |
| 5291 | ..T................T...........T......A........C. |
| C12 | ..T.........T......T...........T......A........C. |
| C43 | ..T................T...........T......A........C. |
| C47 | ..T................T...........T......A........C. |
| C56 | ..T................T...........T......A...G...... |
| O21 | ..T................T...........T......A........C. |
| Haplogroup B: | |
| O23 | ..............C.C....G........................T.. |
| C4 | ..............C.C.............................T.. |
| P14 | ..............C.C.............................T.. |
| 6032 | ..T...........C.C...T.......T.................?.. |
| C30 | .CT...........C.C...T....?..T.........A.......?.. |
| P20 | ..T...........C.C...T....?....................T.. |
| C67 | ......A.......C.C........T..T.................... |
| C42 | ..............C.C.............................?.. |
| N11 | ......AA....T.C.C......................C......... |
| P15 | ......AA....T.C.C......................C......... |
| N64 | ..............C.C................................ |
| BB1 | ..............C.C........?....................?.. |
| BB2 | ..............C.C.............................?.. |
| C39 | ..T...........C.C.......................C...C.... |
| P8 | ..T...........C.C................................ |
| O32 | ..T...........C.C...?....?....................?.. |
| P12 | ..............C.C................................ |
| P19 | ..............C.C.............T.................. |
| 524IV | ..............C.C...?.........................?.. |
| 5292 | ..............C.C........?.......C............?.. |
| C31 | ..............C.C........?....................... |
| C62 | ......A.......C.C........T..T.................... |
| D30 | ..............C.C.........T....................C. |
| C33 | ..............C.C................C.............C. |
| C53 | ..............C.C...........?.................?.. |
| C73 | ..............C.C...?....?.T..................?.. |
| D16 | ..............C.C...?....?....................... |
| C64 | ......A.......C.C........T..T.................... |
| D20 | ...........G..C.C..............T................. |
| D52 | ..............C.C........?..?.................... |
| O39 | ..............C.C................................ |
| C8 | ........G.....C.C..................C....C........ |
| D27 | ........G.......C................................ |
| Haplogroup C: | |
| BB3 | .C........T......T.T.............C......CT....... |
| P11 | .C........T......T.T.............C.......T....... |
| O4A | .C........T......T.T.............C......CT....... |
| O4 | .....T.............T.............C..G...CT....... |
| P3 | ....C..............T.............C......CT....... |
| 5299 | ...................T.............C......CT....... |
| O12 | ......A..C.........T.............C...C..CT....... |
| C9 | G..................T.............C......CT....... |
| P2 | ......A............T.............C...C..CT....... |
| O2A | ...................T.............C......CT......T |
| O3A | ...................T.............C......CT...C... |
| O9 | ...................T.............C......CT....... |
| P5 | ...................T.............C......CT....... |
| C10 | G............T.A...T....................CT.....C. |
| Haplogroup D: | |
| C75 | ...................T..G.G.........T........C...C. |
a
Source: Anderson et al. (1981).