Table 1.
MC1R Haplotype Distributions
HCSa |
Val60Leu |
Asp84Glu |
Val92Met |
Leu106Leu |
Arg142His |
Arg151Cys |
Ile155Thr |
Arg160Trp |
Arg163Gln |
Gln233Gln |
Cys273Cys |
Ile287Met |
Asp294His |
Phe300Phe |
Thr314Thr |
Ser316Ser |
AAC29AAAC |
TTC179TTCC |
Total |
|
Populationor Category | No. (Frequency) of Haplotypes | |||||||||||||||||||
Africa: | ||||||||||||||||||||
Ivory Coast | 14 | … | … | … | 1 | … | … | … | … | … | … | … | … | … | 3 | 18 | … | … | … | 36 |
The Gambia | 13 | … | … | … | … | … | … | … | … | … | … | … | … | … | 4 | 29 | … | … | … | 46 |
U.K. Africans | 10 | … | … | … | … | … | … | … | … | … | … | … | … | … | … | 13 | … | … | … | 24 |
Total | 37(.35) | … | … | … | 1(.01) | … | … | … | … | … | … | 1(.01) | … | … | 7(.07) | 60(.57) | … | … | … | 106 |
African Americans | 22 | … | … | … | 4 | … | … | … | … | 2 | … | … | … | 1 | 3 | 10 | … | … | … | 42 |
Asia: | ||||||||||||||||||||
Southern India | 34 | … | … | … | … | … | … | … | 1 | … | … | … | … | … | 9 | … | … | … | 44 | |
U.K. Asian Indians | 15 | 2 | … | 1 | … | … | … | … | … | 1 | … | … | … | … | … | 3 | … | … | … | 22 |
Papua New Guinea | 20 | … | … | 3 | … | … | … | … | … | 4 | … | … | … | … | … | 5 | … | … | … | 32 |
Japan | 4 | … | … | 2 | … | … | … | … | … | 23 | … | … | 1 | … | … | … | … | … | … | 30 |
Inuit | 2 | … | … | 1 | … | … | … | … | … | 37 | … | … | … | … | … | … | … | … | … | 40 |
Total | 75(.45) | 2(.01) | … | 7(.04) | … | … | … | … | … | 66(.39) | … | … | 1(.01) | … | … | 17(.10) | … | … | … | 168 |
Europe: | ||||||||||||||||||||
England | 30 | 7 | … | 12 | … | 1 | 4 | … | 7 | 2 | … | … | … | … | … | 1 | … | … | … | 64 |
Ireland: | ||||||||||||||||||||
Complete sequence | 15 | 7 | 3 | 6 | … | … | 7 | … | 5 | 3 | … | … | … | … | … | … | … | … | … | 46 |
Partial sequence | 48 | 9 | 48 | 9 | … | … | 4 | 1 | 3 | 3 | … | … | … | 3 | … | … | … | … | … | 76 |
Sweden | 24 | 11 | … | 2 | … | … | 3 | 1 | 5 | 4 | … | … | … | … | … | 1 | 1 | … | … | 52 |
Finland | 10 | 1 | … | 2 | … | … | 3 | … | 4 | 9 | … | … | … | … | … | 1 | … | … | … | 30 |
Saami | 13 | … | … | 6 | … | … | 3 | … | … | 4 | … | … | … | … | … | … | … | … | … | 26 |
Italy | 22 | 7 | … | 1 | … | … | 1 | … | 1 | 1 | … | … | … | … | … | 1 | … | … | … | 34 |
Sardinia | 19 | 5 | … | … | … | … | … | … | … | … | 1 | … | … | 2 | … | 1 | … | … | … | 28 |
Total | 181(.51) |
47(.13) |
4(.01) |
33(.09) |
… |
1(.00) |
25(.07) |
2(.01) |
25(.07) |
26(.07) |
1(.00) |
… |
… |
5(.01) |
… |
5(.01) |
1(.00) |
… |
… |
356 |
No. (Frequency) of Cases |
||||||||||||||||||||
Melanoma in England | 34 | 10 | … | 3 | … | 2 | 3 | … | 1 | 1 | … | … | … | … | … | … | … | … | … | 54 |
Redheads: | ||||||||||||||||||||
Irish | 1 | 3 | … | … | … | … | 6 | … | 4 | … | … | … | … | 5 | … | … | … | … | 1 | 20 |
Swedish | 2 | 2 | 1 | … | … | 2 | 12 | … | 8 | … | … | … | … | 1 | … | … | … | 2 | … | 30 |
Total | 3(.06) | 5(.10) | 1(.02) | … | … | 2(.04) | 18(.36) | … | 12(.24) | … | … | … | … | 6(.12) | … | … | … | 2(.04) | 1(.02) | 50 |