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. 2005 Dec;187(23):8156–8163. doi: 10.1128/JB.187.23.8156-8163.2005

TABLE 2.

Binding of shikimate in HpSK (this work) and in MtSK (7)

Shikimate kinase, subsite, and atom Atom Distance (Å)
HpSK
    CX
        O-2 Arg57 Nη2 3.41
Arg57 Cζ 3.61
Arg57 Nη1 2.93
Arg116 Nη2 3.35
Arg132 Nη2 2.70
Arg132 Cζ 3.60
Arg132 Nη1 3.76
        C-1 Gly81 N 3.63
Arg132 Nη2 3.46
Arg132 Nη1 3.69
        O-3 Gly80 Cα 3.43
Gly80 C 3.55
Gly81 N 3.63
Arg132 Nη2 3.52
Arg132 Cζ 3.63
Arg132 Nη1 2.95
Wat3 O 2.57
        C-4 None
    OLID
        C-5 Phe48 Cζ 3.64
Arg116 Cγ 3.68
        C-6 Val44 Cγ1 3.56
Glu114 O 3.52
        O-7 Glu114 C 3.80
Glu114 O 2.73
Arg116 N 3.05
Arg116 Cα 3.71
Arg116 Cβ 3.49
Arg116 Cγ 3.74
    OCORE
        C-8 Asp33 Oδ1 3.65
Asp33 Oδ2 3.45
Glu114 O 3.14
        O-12 Wat2 O 3.01
Asp33 Cγ 3.47
Asp33 Oδ1 2.84
Asp33 Oδ2 3.36
        C-9 Asp33 Oδ2 3.59
Glu114 O 3.70
Gly80 N 3.64
Met10 Cγ 3.76
        O-11 Asp33 Oδ2 2.78
Wat15 O 3.71
Gly79 Cα 3.37
Gly79 C 3.63
Gly80 N 2.88
Met10 Cγ 3.58
Wat11 O 2.92
        C-10 Gly80 N 3.29
Gly80 Cα 3.55
MtSK
    CX
        O-2 Arg58 Cζ 3.70
Arg58 Nη2 2.59
Gly81 N 3.53
Gly81 Cα 3.58
Arg136 Cζ 3.52
Arg136 Nη1 3.51
Arg136 Nη2 2.84
Leu119 Cδ1 3.06
        C-1 Wat5 O 3.50
Arg58 Nη2 3.77
Gly81 N 3.36
Arg136 Nη1 3.42
Arg136 Nη2 3.57
        O-3 Pro11 Cγ 3.51
Gly80 C 3.63
Wat5 O 3.06
Gly81 N 3.45
Arg136 Cζ 3.35
Arg136 Nη1 2.51
Arg136 Nη2 3.43
        C-4 Wat 3 O 3.57
Wat5 O 3.78
Wat1 O 3.36
    OLID
        C-5 Wat3 O 3.62
Wat1 O 3.28
        C-6 Phe49 Cɛ2 3.72
        O-7 Pro118 Cδ 3.38
Wat3 O 2.95
    OCORE
        C-8 Asp34 Cγ 3.56
Asp34 Oδ1 3.28
Asp34 Oδ2 3.28
Wat1 O 3.67
        O-12 Asp34 Cγ 3.16
Asp34 Oδ1 2.53
Asp34 Oδ2 3.10
Gly79 Cα 3.47
Wat1 O 2.53
        C-9 Asp34 Oδ2 3.51
Wat6 O 3.71
Wat2 O 3.73
        O-11 Asp34 Cγ 3.69
Asp34 Oδ2 2.67
Wat 6 O 3.15
Gly79 Cα 3.74
Gly80 N 3.10
Wat2 O 2.86
        C-10 Gly80 N 3.47
Gly80 Cα 3.74
Wat1 O 3.76