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. 2003 Jan;84(1):171–184. doi: 10.1016/S0006-3495(03)74840-1

TABLE 2.

Hydrogen bonds (beyond the backbone) formed by residues of TMs

Donor
Acceptor
Location Residue Group Group Residue Distance (Å)
TM4-TM2 Trp161 NɛH Nɛ His79 3.28
TM2-TM4 Tyr76 OH O=C< Glu153 3.52
TM2-TM4 Lys75 NɛH OH Tyr157 2.68
TM4-TM2 Lys154 NɛH OH Ser71 2.70
TM2-TM2 Met72 NH OH Ser71 3.00
TM4-TM4 Thr168 OH O=C< Ala164 2.76
TM1-TM2 Asn56 NδH Oδ1 Asp84 2.70
TM1-TM2 Asn56 NδH O=C< Leu80 2.74
TM2-TM2 Thr90 OH O=C< Leu86 2.74
TM5-TM5 Gln202 NɛH NɛH His203 3.18
TM5-TM5 Ser217 OH O=C< Ile213 2.74
TM5-TM5 Ser224 OH O=C< Cys220 2.74
TM6-TM6 Thr240 OH O=C< Ala237 2.71
TM7-TM6 Thr287 OH Oδ1 Asp262 2.66
TM1-TM7 Tyr45 OH Oɛ1 Glu288 2.60
TM7-TM3 Tyr302 OH Oδ1 Asp133 2.61
TM3-TM3 Arg134 Nη1H Oδ2 Asp133 2.59
TM3-TM3 Arg134 Nη2H Oδ2 Asp133 2.60
TM3-TM7 Arg134 Nη1H OH Tyr302 2.61
TM2-TM7 Arg77 NɛH O=C< Ala303 3.26
TM2-TM7 Arg77 Nη1H O=C< Ala303 2.73
TM2-TM2 Arg77 Nη2H O=C< Thr73 2.73
TM2-TM7 Thr73 OH O=C< Gly306 2.84
TM2-TM2 Ser81 OH O=C< Leu78 2.71
TM3-TM3 His113 NδH O=C< His113 2.87
TM3-TM3 Ser122 OH O=C< Asn119 2.71
TM3-TM3 Ser123 OH O=C< Leu120 2.75
TM3-TM3 Ser131 OH O=C< Ala128 2.73
TM7-TM7 His294 Nɛ O=C< Leu290 2.78