TABLE 3.

Species identification for the clinical isolates in the pyrosequencing assay presented with their corresponding result in the biochemical test systems VITEK 2 and Rapid ID 32 Strep

Pyrosequencing identification	No. of samples	Biochemical identification	No. of samples
			VITEK 2	RID32a
S. agalactiae	14	S. agalactiae	13	14
		Unidentified	1	0
S. anginosus	2	S. anginosus	2	2
S. constellatus/S. anginosus	4	S. constellatus/S. anginosus	1	0
		S. anginosus	2	2
		S. constellatus	1	2
S. dysgalactiae	21	S. dysgalactiae	21	4
		S. dysgalactiae subsp. equisimilis	0	16
		S. canis/S. dysgalactiae subsp. equisimilis	0	1
S. gallolyticus	2	S. gallolyticus	1	0
		S. bovis biovar I	0	1
		S. bovis biovar II	1	1
S. gordonii	4	S. gordonii	4	2
		S. parasanguinis	0	2
S. infantis/S. peroris	2	S. mitis/S. oralis/Gemella spp.	1	0
		S. acidominimus	0	1
		S. mitis	0	1
		Unidentified	1	0
S. intermedius	1	S. intermedius	1	1
S. mitis	5	S. mitis	0	2
		S. mitis/S. oralis	3	1
		S. parasanguinis	0	1
		S. mitis/S. sanguinis	0	1
		Unidentified	2	0
S. mitis/S. pneumoniae	2	S. mitis/S. oralis	2	2
S. mutans	1	S. mutans	1	1
S. oralis	4	S. oralis	0	4
		S. mitis/S. oralis	3	0
		S. intermedius/S. mitis/S. oralis	1	0
S. parasanguinis	3	S. parasanguinis	0	3
		S. mitis/S. oralis	1	0
		Unidentified	2	0
S. pneumoniae	17	S. pneumoniae	13	11
		S. mitis/S. oralis	3	1
		S. mitis/S. oralis/S. pneumoniae	1	0
		S. oralis/S. pneumoniae	0	2
		S. oralis	0	1
		S. mitis	0	2
S. pyogenes	17	S. pyogenes	17	17
S. salivarius	7	S. salivarius	5	6
		S. salivarius/S. vestibularis	1	0
		S. bovis biovar II	0	1
		Unidentified	1	0
S. sanguinis	5	S. sanguinis	4	3
		S. sanguinis/S. mitis	0	1
		S. mitis	0	1
		S. mitis/S. oralis/Gemella spp.	1	0
S. vestibularis	2	S. vestibularis	1	1
		S. salivarius	0	1
		Unidentified	1	0

^aThat is, Rapid ID 32 Strep.