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. 2002 Feb;22(3):704–723. doi: 10.1128/MCB.22.3.704-723.2002

TABLE 1.

Primers used for bisulfite genomic sequencing

Primer name Sequence (5′ → 3′)
Luciferase Region 1 topF TTTAATGTATAGATTTGAAGAAGAGT
Luciferase Region 1 topR TCTCAATAAACCCATATCCTTATC
Luciferase Region 2 topF AATATAAAGGATATTAGGTGGTT
Luciferase Region 2 topR TATAAAAATCTCTCTAATTTTTCTTA
EBNA1 Region 1 topF TGGTGAGTATTTAATTAAGTTATTT
EBNA1 Region 1 topR TCAAAATCACCAAACAAAAATAC
EBNA1 Region 1 bottomF AAAGGAAGAGTATGAGTATTTAAT
EBNA1 Region 1 bottomR CCAAATCATTCTAAAAATAATATATA
EBNA1 Region 2 topF TATTAGGGTTATTGTTTTATGAG
EBNA1 Region 2 topR TCAAAATCACCAAACAAAAATAC
EBNA1 Region 2 bottomF TTAAGGTTATTAGATAGAGATG
EBNA1 Region 2 bottomR TTCAATATTATTAAAACATTTATCA
EBNA1 Region 3 topF TTGAAGAGGAAGAGGAGGGGTTT
EBNA1 Region 3 topR CTAAAAAAAATCAATAAACATCTTTATTAA
EBNA1 Region 3 bottomF ATATTAAAAGAGATTAATAGATATT
EBNA1 Region 3 bottomR ATCTCTATCTAATAACCTTAAAA
EBNA1 Region 4 topF GGAGATATATTTGGATTAGAAGGT
EBNA1 Region 4 topR CCCTTTACAACCAATACAACTTAA
EBNA1 Region 4 bottomF GGGTTTTTTTGTAGTTAATGTAATTTG
EBNA1 Region 4 bottomR AAAACACATCTAAACCAAAAAACTC
EBNA1 Region 5 topF TAAGAGTTTTTTTGGTTAGGAGTT
EBNA1 Region 5 topR ATAACAAACAATAAACTCCCTTAA
EBNA1 Region 5 bottomF AAGATTATGAAATAATAGATAATGGAT
EBNA1 Region 5 bottomR TTAAAAACTCTCCTAACTAAAAATCA
EBNA1 Region 6 topF GAATAAATTTTTAGTAGATATTATG
EBNA1 Region 6 topR TTCCTACTAATTACTCCCATTC
EBNA1 Region 6 bottomF TGTTGGTTGTTTTTATTTTTAG
EBNA1 Region 6 bottomR AATAAATCCCCAATAAACATC