TABLE 2.
Probe ID | Sequence | Tm (°C)a |
---|---|---|
01 | 5′-GATTGCGGT-NH2-3′ | 34 |
02 | 5′-GTCATGGTG-NH2-3′ | 34 |
03 | 5′-GTCGCCATA-NH2-3′ | 34 |
04 | 5′-TCATCGCGT-NH2-3′ | 34 |
05 | 5′-TTGGTGGCT-NH2-3′ | 34 |
06 | 5′-CGGTATAAC-NH2-3′ | 32 |
07 | 5′-GAACAACGT-NH2-3′ | 32 |
08 | 5′-CGTTGAAGT-NH2-3′ | 32 |
09 | 5′-GTCAACAAC-NH2-3′ | 32 |
10 | 5′-AAGGCAAAC-NH2-3′ | 32 |
11 | 5′-ATTTCGGCA-NH2-3′ | 32 |
12 | 5′-GCTGTTTAC-NH2-3′ | 32 |
13 | 5′-TGTTTGTCG-NH2-3′ | 32 |
14 | 5′-AATCAGCTG-NH2-3′ | 32 |
15 | 5′-AATTGCTGC-NH2-3′ | 32 |
16 | 5′-ATGGCAATC-NH2-3′ | 32 |
17 | 5′-CAACTACAC-NH2-3′ | 32 |
18 | 5′-CAGATGATG-NH2-3′ | 32 |
19 | 5′-CGATGATGA-NH2-3′ | 32 |
20 | 5′-CTAACGACT-NH2-3′ | 32 |
21 | 5′-CTACGCTTA-NH2-3′ | 32 |
22 | 5′-GGACTTTCT-NH2-3′ | 32 |
23 | 5′-TATAGCCGT-NH2-3′ | 32 |
24 | 5′-TGGCATCAA-NH2-3′ | 32 |
25 | 5′-CGCTTTGGT-NH2-3′ | 34 |
26 | 5′-CGTTTGCAG-NH2-3′ | 34 |
27 | 5′-GGACAAACG-NH2-3′ | 34 |
28 | 5′-AACGCCATC-NH2-3′ | 34 |
29 | 5′-AAGTCAGCG-NH2-3′ | 34 |
30 | 5′-ACATCGGCA-NH2-3′ | 34 |
31 | 5′-ACCGTCTTC-NH2-3′ | 34 |
32 | 5′-ACGAACTGG-NH2-3′ | 34 |
33 | 5′-ACGACCAGA-NH2-3′ | 34 |
34 | 5′-ACGCTGAAG-NH2-3′ | 34 |
35 | 5′-AGCAGTTCC-NH2-3′ | 34 |
36 | 5′-AGTGGCAAC-NH2-3′ | 34 |
37 | 5′-ATACCGGTG-NH2-3′ | 34 |
38 | 5′-ATCTTCCGG-NH2-3′ | 34 |
39 | 5′-ATTCCGGCA-NH2-3′ | 34 |
42 | 5′-CCTGCATTG-NH2-3′ | 34 |
43 | 5′-CGGCAATCT-NH2-3′ | 34 |
44 | 5′-CGGTTAACC-NH2-3′ | 34 |
45 | 5′-GATGCCGTT-NH2-3′ | 34 |
46 | 5′-GCAGGTGAA-NH2-3′ | 34 |
47 | 5′-GTCCTTGAC-NH2-3′ | 34 |
48 | 5′-TCAGTGGCA-NH2-3′ | 34 |
49 | 5′-TGGCATTGC-NH2-3′ | 34 |
The approximate melting temperature was calculated using the nearest-neighbor method.