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. 2002 Dec;68(12):6361–6370. doi: 10.1128/AEM.68.12.6361-6370.2002

TABLE 2.

Sequences for the random nonamer capture probes

Probe ID Sequence Tm (°C)a
01 5′-GATTGCGGT-NH2-3′ 34
02 5′-GTCATGGTG-NH2-3′ 34
03 5′-GTCGCCATA-NH2-3′ 34
04 5′-TCATCGCGT-NH2-3′ 34
05 5′-TTGGTGGCT-NH2-3′ 34
06 5′-CGGTATAAC-NH2-3′ 32
07 5′-GAACAACGT-NH2-3′ 32
08 5′-CGTTGAAGT-NH2-3′ 32
09 5′-GTCAACAAC-NH2-3′ 32
10 5′-AAGGCAAAC-NH2-3′ 32
11 5′-ATTTCGGCA-NH2-3′ 32
12 5′-GCTGTTTAC-NH2-3′ 32
13 5′-TGTTTGTCG-NH2-3′ 32
14 5′-AATCAGCTG-NH2-3′ 32
15 5′-AATTGCTGC-NH2-3′ 32
16 5′-ATGGCAATC-NH2-3′ 32
17 5′-CAACTACAC-NH2-3′ 32
18 5′-CAGATGATG-NH2-3′ 32
19 5′-CGATGATGA-NH2-3′ 32
20 5′-CTAACGACT-NH2-3′ 32
21 5′-CTACGCTTA-NH2-3′ 32
22 5′-GGACTTTCT-NH2-3′ 32
23 5′-TATAGCCGT-NH2-3′ 32
24 5′-TGGCATCAA-NH2-3′ 32
25 5′-CGCTTTGGT-NH2-3′ 34
26 5′-CGTTTGCAG-NH2-3′ 34
27 5′-GGACAAACG-NH2-3′ 34
28 5′-AACGCCATC-NH2-3′ 34
29 5′-AAGTCAGCG-NH2-3′ 34
30 5′-ACATCGGCA-NH2-3′ 34
31 5′-ACCGTCTTC-NH2-3′ 34
32 5′-ACGAACTGG-NH2-3′ 34
33 5′-ACGACCAGA-NH2-3′ 34
34 5′-ACGCTGAAG-NH2-3′ 34
35 5′-AGCAGTTCC-NH2-3′ 34
36 5′-AGTGGCAAC-NH2-3′ 34
37 5′-ATACCGGTG-NH2-3′ 34
38 5′-ATCTTCCGG-NH2-3′ 34
39 5′-ATTCCGGCA-NH2-3′ 34
42 5′-CCTGCATTG-NH2-3′ 34
43 5′-CGGCAATCT-NH2-3′ 34
44 5′-CGGTTAACC-NH2-3′ 34
45 5′-GATGCCGTT-NH2-3′ 34
46 5′-GCAGGTGAA-NH2-3′ 34
47 5′-GTCCTTGAC-NH2-3′ 34
48 5′-TCAGTGGCA-NH2-3′ 34
49 5′-TGGCATTGC-NH2-3′ 34
a

The approximate melting temperature was calculated using the nearest-neighbor method.