TABLE 1.

Primers used for generation of probes^a

Locus	Primer
194.m00115 F	5′-ATGGGCAATAGACCCAACAC-3′
194.m00115 R	5′-TCCATAAATTTTTGCATGACCA-3′
2.m00567 F	5′-ATGAACGCTATTAAACCTAAAACAAT-3′
2.m00567 R	5′-CTATTATTTGTCTGAATTGTCTAAAGCTG-3′
2.m00567 putative promoter region F	5′-AAAAGCCATTGAAAATGGATG-3′
2.m00567 putative promoter region R	5′-TCCATCAACATCCAATACAATTG-3′
238.m00054 segment #1 F	5′-ATGGCTGAACAAATCAGAGTCTGACA-3′
238.m00054 segment #1 R	5′-CTAAAGTAATAATGCTGGAACATTTGGATGG-3′
238.m00054 segment #2 F	5′-GAATCACCGAATGTTATTGCATCTGG-3′
238.m00054 segment #2 R	5′-CTACTGTGAATCTTTAACACGGATGTTCGA-3′
238.m00054 segment #3 F	5′-TCGAACATCCGTGTTAAAGATTCACAG-3′
238.m00054 segment #3 R	5′-CTACATTGTCTTTCCTCCAATTTCATCTCC-3′
29.m00210 F	5′-ATGCAACAAGAGACAGTTGTTGG-3′
29.m00210 R	5′-CTATTATTTTTGTGCAAAGAATTTCTCT-3′
29.m00231 F	5′-CCCCTTCATCGACAAACAAT-3′
29.m00231 R	5′-TCGATGACGTCTTGATTTGG-3′
297.m00063 F	5′-TCAGCATGGATTTGATTGGA-3′
297.m00063 R	5′-CAGCAACACCTTTTTCAACG-3′
5.m00482 F	5′-TCTGGTGCTTTTGATGTTGC-3′
5.m00482 R	5′-CCACCGAAGGATCACACTCT-3′
51.m00161 F	5′-GTCAAAGAGCTGTTGCATGG-3′
51.m00161 R	5′-TTCTGCAACATTTCCTGGTG-3′
6.m00454 F	5′-GATTCTTCATTTGCCGTGCT-3′
6.m00454 R	5′-CCGAATGAAGCCCAATTATC-3′
6.m00467 F	5′-AATGGGCACAACCTATTGCT-3′
6.m00467 R	5′-TTTCCCCATTCAAAGCATGT-3′
9.m00419 F	5′-AACCACCAAAAATTCCACCA-3′
9.m00419 R	5′-AATTGGTGAACGGGCAGTAG-3′
EhActin F	5′-GCTGGTATGGGTCAAAAGGA-3′
EhActin R	5′-TTTCTGTGGACAATAGCTGGTC-3′
EhLINE1 ORF1 F	5′-GATCCTTTTCCAATGCAGGA-3′
EhLINE1 ORF1 R	5′-TGCTTTTCTCTTCGATTTCCA-3′
EhLINE1 ORF2 F	5′-TGAARATAGGGATTACTTCMGTGT-3′
EhLINE1 ORF2 R	5′-CCCATTAGACATGGTAAGTGGAA-3′
M13 F	5′-TGTAAAACGACGGCCAGT-3′
M13 R	5′-CAGGAAACAGCTATGACC-3′

^aProbes were used for Northern blot analyses and sequencing particular loci in E. histolytica Rahman. T_m values ranged between 56 and 58°C.