TABLE 1.
CEN | Sequence | Length (bp) | AT (%) | Runsa |
---|---|---|---|---|
I | ACATAATAATAAATAATTTTAAAAATATAAAATATTTTTAATAGTTTTTAAATATTTTACAGTTTATTTTTTAAATTTATTTATAT– | 86 | 95.3 | 0.38 |
II | ACTTATTTATTTAATTATTATTAAGTAAAAAAGATTTTCTATTTAAATTTATTAATTAATTTTTTTTCTTAAATAATTATTTTAT— | 85 | 94.1 | 0.26 |
III | ATGATATTTGATTTTATTATATTTTTAAAAAAAGTAAAAAATAAAAAGTAGTTTATTTTTAAAAAATAAAATTTAAAATATTAGT— | 85 | 92.9 | 0.53 |
IV | CTTATAATCAACTTTTTTAAAAATTTAAAATACTTTTTTATTTTTTATTTTTAAACATAAATGAAATAATTTATTTATT——— | 79 | 92.4 | 0.37 |
V | CTTTTTAAAAAATATAAATTTAATTTCATTTTCTATTTCAATATTTATTAAATAAAAAATTTGAAAAATATATAAAAATTGTAGCA– | 86 | 90.7 | 0.36 |
VI | CTATAAAAATAATTATAATTTAAATTTTTTAATATAAATATATAAATTAAAAATAGAAAGTAAAAAAAGAAATTAAAGAAAAAATA– | 86 | 94.2 | 0.34 |
VII | TTATATTTACTATATAAAAATTCAATAAATAAAAAGTTAGAAGATAAAAATTATATTATACATATTTTTATTTTTATTATAATTTTT- | 87 | 93.1 | 0.35 |
VIII | ACTAATAATTCTTTTAATTTTAATTAATTTAATAAAATTAAAATAATATATATACTAAATTGTTTATTAAAAATGATTAAACATTG– | 86 | 91.9 | 0.24 |
IX | AAAATTTTTATATTTTTAATTAAATTTTTATAATATTATAAATTATTATAATATTGATATTTAAAATTAAAAACAAATTATTAAT— | 85 | 97.6 | 0.33 |
X | TTAAATAATTAATTTACTTTAAAATTTATTTTTTAATATAAAATATTTATTCTTTTTATTTAAAAATAAAAAACACAAAAAAACAAT- | 87 | 94.3 | 0.43 |
XI | ATAAAAACATATTTAAAATTTTAAAAAAATTAATTTTCAAAATAAATTTATTATATTTTTTTAATTACATAATCATAAAAATAAAT– | 86 | 95.3 | 0.47 |
XII | TAATAAATATTATTAAAAAGTTTATTAAAATAAAATAATAATTTAAATTACTATTTTTAAATAAGTTTTATTTTTTAATAACACTATT | 88 | 94.3 | 0.33 |
XIII | ACTACCTAACAAAATATTTATTTTTCTTTTTTAATATTTGAAAATACTAAAATATTTTTGTTGTTTTTTGAAAAAAGGATTTTTAAT- | 87 | 86.2 | 0.52 |
XIV | CAGCTTTTTAAAAATATTTTAAAACATTTTAAAAAATATACATTTTTTTATTATTTTTTTATATATTAATGTTAAAATTTATTTAT– | 86 | 93.0 | 0.53 |
XV | AACTTATTTTGCATTTAAAAAAAAGTAAAAACTATTTGCTAAAATATATTTTTTTAATTTTTAAAAATAATGTTTTAATTATTTAAT- | 87 | 90.8 | 0.49 |
XVI | ATATATTTTTTATTTTTAATTTTTTTTAATTATAAAAATAATTTTTTTCTTTAAATTAAACAAAAATAAAAAATTGTTTTTTGTT— | 85 | 95.3 | 0.56 |
Mean | 85.7 | 93.2 | 0.41 | |
SD | 2.0 | 2.6 | 0.10 |
Fraction of base pairs in homopolymer runs of N ≥ 4.