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. 2002 Apr;76(7):3158–3167. doi: 10.1128/JVI.76.7.3158-3167.2002

TABLE 1.

Primers and probes

Procedure (figure) and oligonucleotide Type Sequence Nucleotide coordinates in HCMV AD169
RT-PCR (Fig. 1)
    E2 (IE72/IE86) Primer (sense) 5′-GACACGATGGAGTCCTCTGC-3′ 172771-172752
    E4R (IE72) Primer (antisense) 5′-AATAGTTACTGGTACTGGTCAGCCT-3′ 171000-171019
    E5R (IE86) Primer (antisense) 5′-TTTCACTTACTGAGACTTGT-3′ 169358-169377
    E1(+1) Primer (sense) 5′-TCAGTCGCCTGGAGACGCCAT-3′ 173730-173709
    E1(−60) Primer (sense) 5′-AATGGGCGGTAGGCGTGTAC-3′ 173790-173771
    E1(−130) Primer (sense) 5′-GGAGTTTGTTTTGGCACCAA-3′ 173860-173841
RT-PCR (Fig. 5)
    IE72/IE9 Primer (sense) 5′-TGGTCAGCCTTGCTTCTAGT-3′ 171010-171029
Primer (antisense) 5′-TAACAGTCAGCTGAGTCTGG-3′ 172529-172501
     Probe 5′-TCTCAGACACTGGCTCAGAC-3′ 171112-171132
    UL112-113 Primer (sense) 5′-AACGTCACGAAGAACGGCGA-3′ 161151-161170
     Primer (antisense) 5′-TTGAGAAAGGCCACCGCTTC-3′ 161680-161661
Probe 5′-TGCTCCGTCTCGTTCTTGCC-3′ 161590-161571
    β-Actin Primer (sense) 5′-CAAGAGATGGCCACGGCTGCT-3′
     Primer (antisense) 5′-TCCTTCTGCATCCTGTCGGCA-3′
RT-PCR (Fig. 6)
    HsOrc1 Primer (sense) 5′-CCTTCTCGGAGATCACCTCA-3′
Primer (antisense) 5′-TCTTCGTCACTGCTAGAGTC-3′