TABLE 1.

Summary of magnesium ion contacts in the H. marismortui large ribosomal subunit

Mg2+	Inner sphere contacts	Outer sphere contacts	Class
38		2115 O4, 2116 O4, 2271 N7, 2274 N7, 2275 N7, 2275 O6, 2276 O4	0
55		2720 OP1, 2721 OP2, 2721 OP1, 333 OE2 (L3), 333 OE1 (L3), 32 CO (L24e)	0
63		1363 O6, 1363 N7, 1364 O6	0
65		782 O2′, 783 OP1, 15 CO (L2), 17 CO (L2), 179 CO (L2), 180 CO (L2), 182 CO (L2), 184 CO (L2)	0
71		1813 O4, 1815 OP1, 1816 OP2, 1817 O4, 1818 N3, 1818 N4	0
76		1418 O2′, 1419 OP2, 1443 N7, 1443 O6, 1444 O6, 15 OD1 (L32e)	0
100		2064 O4, 2079 N7	0
107		1977 OP1, 1978 OP1, 1986 O6, 2000 N7	0
114		1848 OP2, 1849 OP2	0
12	28 OP1	1304 OP1, 1305 OP1, 1305 OP2, 1343 OP2, 1344 OP1	I
17	456 OP2	455 OP2, 455 OP1, 457 OP1, 458 OP1, 85 CO (L4), 86 CO (L4)	I
19	2011 OP2	1890 O2′, 1891 OP2, 1891 O6, 1891 N7, 1892 N4, 1941 OP2	I
20	1830 OP1	1828 N3, 1828 O2′, 1828 N2, 1831 OP1, 1832 O6, 1842 OP1, 1842 OP2	I
21	2304 OP2	2301 OP2, 2303 OP1, 2304 N7, 2305 N7, 2305 OP2, 2306 O4	I
24	1381 N7	1380 O2′, 1380 OP1, V23 ND1	I
32	2115 OP1	2116 OP2, 2272 OP1, 2273 OP2, 196 CO (L2), 199 CO (L2)	I
35	1484 OP2	1455 OP2, 1456 OP2, 1457 O4, 1484 N7, 1485 OP2	I
36	956 OP1	955 OP1, 955 OP2, 956 N7, 957 N7, 1006 OP1, 1006 OP2	I
37	2553 OP2	2552 O2′, 2554 OP2, 2575 OP1, 2576 OP2, 2576 N7	I
39	115 OP1	112 OP2, 114 O2′, 117 N7, 118 N7, 118 O6, 119 N6	I
40	392 OP2	171 OP1, 172 OP1, 391 OP2	I
45	1979 OP1	1998 OP1, 1999 OP1, 1999 OP2	I
46	1794 N7	1793 OP2, 1794 OP1, 1796 OP1, 1796 OP2	I
47	1098 OP2	1097 OP1, 1099 O6, 1099 N7, 125 CO (L30)	I
50	2248 OP2	2247 OP1	I
51	641 OP2	641 N7, 642 N7, 1355 N3, 1355 OP2	I
53	471 O6	469 O2′, 470 O4, 881 O2′, 882 OP2, 883 O4, 888 O2′	I
58	2013 OP1	1883 OP2, 1884 OP1, 2626 OP1, 207 OE1 (L2) 207 CO (L2)	I
59	2618 OP1	2619 OP2, 2641 OP2, 2642 OP2, 2642 N7, 2643 O6, 2643 N7	I
60	175 OP2	172 OP1, 173 OP2, 173 OP1, 225 OP1, 392 OP1, 393 OP1, 393 OP2	I
68	2568 OP2	2567 OP1, 2567 OP2, 2568 N7, 2569 N7, 2569 OP2, 2569 N6	I
69	42 OD1 (L14)	1749 OP2, 2546 OP1, 2583 OP1, 2584 OP2	I
72	954 OP1	2298 OP1, 2299 OP2, 2301 OP1	I
83	1754 OP2	1753 OP2, 1754 N7, 1755 N7, 1755 OP2	I
84	1742 OP2	1742 N7, 1743 O6, 1743 N7, 1744 N7, 1744 O6, 1745 O6, 2033 OP1, 2033 N7	I
85	2618 OP1	2617 O2′, 2641 OP2, 2641 OP1, 2642 OP2	I
90	2103 OP2	2102 OP2, 2479 N7	I
91	918 OP1	2293 OP1, 2391 OP1, 2465 N7, 2465 OP2	I
92	1844 OP2	1843 OP1, 1845 N6, 1845 N7, 1845 OP2	I
98	907 N7	906 OP2, 907 OP2, 907 N6	I
105	817 O6	795 O6, 816 N7, 816 OP2, 817 N7, 90 OG (L19e)	I
110	2609 N7	2606 O6, 2606 N7, 2609 O6, 2609 OP2, 2610 O4	I
111	187 N1	155 OP1, 188 O2, 206 O2′, 207 OP1, 438 O2	I
112	2112 N7	2112 OP2, 2112 N6, 2113 O6	I
113	2430 N1	220 OP1, 2430 N6, 2431 N3, 2431 O2, 2468 OP1	I
115	1850 O4	1849 N7	I
4	456 O6, 459 OP1	455 N7, 455 OP2, 456 N7, 460 OP1, 477 OP1	IIa
9	2611 OP1, 2612 OP1	2093 OP2, 2094 OP1, 2094 OP2	IIa
11	824 N7, 854 N7	823 OP2, 824 O6, 824 OP2, 853 OP2, 854 O6, 854 OP2	IIa
13	877 OP1, 2623 OP1	885 O6, 2475 OP2, 2624 OP2, 195 OD1 (L2)	IIa
14	2102 OP2, 2537 OP2	2101 O2′, 2101 N3, 2480 N7, 2536 O2′	IIa
18	1291 OP2, 1292 OP2	909 OP2, 910 OP2, 911 O6, 1292 N7	IIa
22	2097 OP2, 2540 OP2	2095 OP2, 2096 O2′, 2097 N7	IIa
23	2617 OP2, 2618 OP2	2616 O2′, 2618 N7	IIa
25	1120 OP2, 1121 OP2	1121 N7, 1238 OP1	IIa
27	240 OP1, 269 O6	267 OP2, 268 OP1, 269 N7, 146 NE2 (L15e)	IIa
28	1448 OP2, 1677 O4	1676 N7, 1676 O6, 54 CO (L23)	IIa
29	1503 OP2, 1679 OP2	1504 OP2	IIa
30	1748 OP2, 1749 OP1	2584 OP2, 2585 OP2	IIa
31	777 OP2, 778 OP2		IIa
34	2302 OP1, 2303 OP1	2301 N3, 2304 O6, 2305 N6	IIa
42	1309 O2, 1346 O2	1309 O2′, 1346 O2′	IIa
43	816 O6, 817 O6	795 O2′, 815 OP2	IIa
48	2746 OP2, 2750 OP2	2745 OP1, 2745 OP2, 2749 OP2	IIa
49	2421 OP1, 2423 OP1	2402 OP1	IIa
54	162 OP1, 2276 OP1	163 OP2, 169 OP2	IIa
56	2757 OP1, 335 CO (L3)	2719 OP2, 2720 OP2, 2758 OP2, 337 CO (L3)	IIa
61	1369 OP2, 2650 OP2	1371 O2′, 2649 OP1	IIa
66	1873 OP2, 26 OD2 (L2)		IIa
70	166 OP2, 219 O6	165 O2′, 219 N7, 221 N3	IIa
74	1286 OP1, 1287 OP1	1287 N7, 71 OE1 (L30), 72 CO (L30), 73 CO (L30), 75 CO (L30)	IIa
75	907 O2′, 908 O4′	907 N3, 1270 OP2, 1328 N6	IIa
80	1684 OP1, 1724 OP1	1431 OP1, 1691 N3, 1722 O2	IIa
86	532 OP1, 533 OP2	10 O4, 534 OP1, 2814 N1	IIa
87	682 OP2, 683 OP2	683 N7	IIa
88	2540 O6, 2611 O2′	2540 N7, 2612 OP2, 2614 OP1, 2646 OP2, 2647 N4	IIa
93	1070 O2′, 1071 OP1	627 OP1, 913 N6, 914 N1, 1071 N7	IIa
95	956 OP2, 957 OP2	921 O6	IIa
96	1848 O6, 1849 O6	1847 OP2, 1848 N7, 1849 N7, 1883 O4	IIa
97	863 O6, 864 O4	782 O6, 862 O4, 863 N7	IIa
101	2281 OP2, 2282 O4	2107 OP1, 2286 OP1	IIa
102	2434 N3, 2458 O2	2434 O2′, 2458 O2′, 66 OD1 (L44e)	IIa
103	2578 OP2, 2579 OP1		IIa
104	2104 OP1, 2105 OP2	2474 OP1, 2474 OP2	IIa
106	1106 OP1, 1107 OP2	1103 OP1, 1104 OP2, 1107 N7	IIa
109	903 OP1, 1357 N7	622 O2′, 904 OP1, 1356 O2′, 1357 N6	IIa
15	844 OP1, 1689 OP1	844 N7, 882 N1, 1688 O2′, 1689 N7, 1690 N4, 1692 N3, 5 OG (L37e)	IIb
52	1125 OP2, 92 OP1 (5S)	1126 OP2, 1129 O2, 1129 N3, 90 O6 (5S), 92 OP2 (5S)	IIb
62	1489 OP2, 1491 O6	1487 OP2, 1488 OP1, 1490 OP2, 1490 N7, 1491 N7	IIb
77	880 OP1, 883 OP2	882 OP1, 884 OP2, 1836 N6, 1836 N7	IIb
94	1096 OP2, 1257 OP2	1258 N7	IIb
1	2483 OP2, 2533 OP2, 2534 OP2	2482 O2′, 2484 OP2, 2532 O2′	IIIa
3	876 OP2, 877 OP2, 2624 OP1	193 CO (L2), 195 OD1 (L2)	IIIa
6	821 OP1, 822 OP2, 854 OP1	855 OP2, 856 OP1	IIIa
16	1504 OP1, 1678 OP1, 1679 OP1		IIIa
26	2608 OP1, 2609 OP1, 2610 OP2	2542 OP1	IIIa
64	2277 O4, 2278 O4, 2471 O6	2113 O6	IIIa
	45 CO (L44e), 47 CO (L44e), 49 OD1
78	(L44e)	2121 OP1, 2122 OP1	IIIa
79	165 N7, 167 OP1, 168 OP2	164 N7, 164 OP2, 165 OP2	IIIa
89	516 OP2, 517 OP2, 518 N7		IIIa
	133 CO (L32e), 136 CO (L32e), 139 CO
108	(L32e)	137 CO (L32e)	IIIa
116	1840 O2′, 1841 OP2, 2022 N7	1840 N3, 2022 OP2	IIIa
2	627 O6, 2483 OP1, 2534 OP1	625 O2′, 626 O4	IIIb
5	1836 OP1, 1838 OP1, 1839 OP1	1837 OP1	IIIb
7	832 OP2, 1839 OP2, 1840 OP2	833 OP1	IIIb
8	919 OP1, 2464 OP1, 2465 OP1	2466 OP2	IIIb
10	836 OP1, 2615 OP1, 230 OE1 (L3)	2616 OP2, 230 CO (L3)	IIIb
41	196 OP1, 227 O2′, 228 O4′	227 N3	IIIb
81	1420 OP1, 1421 OP2, 1438 OP2		IIIb
33	1747 OP1, 1748 OP1, 1749 O4, 2585 OP1	2586 OP2	IV
	37 OE1 (L24), 111 CO (L24), 112 CO (L24)
73	114 CO (L24), 117 CO (L24)	35 CO (L24)	V
44	2048 OP1, 2089 OP1, 65 CO (L22)	2047 OP1	X
57	1883 OP2, 2012 O2′, 207 CO (L2)		X
	1845 OP1, 1846 OP1, 1884 O6, 188 CO
67	(L2)	1883 O4	X
82	1437 OP2	1424 N7, 1424 OP2, 1425 N7, 1436 OP2	X
99	2612 O2′	2647 OP2, 2648 OP2	X