TABLE 2.
Molecular analysis of SCAs in MT-TGFα mice
| Genotype | LOHa
|
Methylation of p16Ink4a | Expression
|
Other lesion | Gene inactivationb
|
|||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| p53 | Ink/Arf | p16 | p19 | p53 | p19Arf | p16Ink4a | p53 | |||
| Ink/Arf−/− | ||||||||||
| A1 | − | Null | − | − | − | − | Y | Y | N | |
| A2 | − | Null | − | − | − | − | Y | Y | N | |
| A3 | − | Null | − | − | − | − | Y | Y | N | |
| A4 | − | Null | − | − | − | − | Y | Y | N | |
| Ink/Arf+/− | ||||||||||
| B1 | NDc | ND | − | − | − | − | Y | Y | N | |
| B2 | − | + | − | − | − | − | Y | Y | N | |
| B3 | − | + | − | − | − | − | Y | Y | N | |
| B4 | − | + | − | − | − | − | Y | Y | N | |
| B5 | − | + | − | − | − | − | Y | Y | N | |
| B6 | − | + | − | ND | ND | ND | Y | Y | N | |
| B7 | − | + | − | ND | ND | ND | Y | Y | N | |
| Ink/Arf+/−p53+/− | ||||||||||
| C1 | + | − | − | − | − | − | 1 | 1 | Y | |
| C2 | + | − | − | − | − | − | 1 | 1 | Y | |
| C3 | + | + | − | − | − | − | Y | Y | Y | |
| C4 | + | + | − | − | − | − | Y | Y | Y | |
| C5 | − | + | − | − | − | − | Y | Y | N | |
| C6 | + | + | − | − | − | − | Y | Y | Y | |
| C7 | − | − | − | −d | − | − | Splice defecte | Y | Y | N |
| C8 | + | + | − | ND | ND | ND | Y | Y | Y | |
| Ink/Arf+/−p53−/− | ||||||||||
| D1 | Null | + | − | − | − | − | Y | Y | Y | |
| D2 | Null | + | − | − | − | − | Y | Y | Y | |
| p53+/− | ||||||||||
| E1 | + | − | − | − | − | − | 1 | 1 | Y | |
| E2 | + | − | + | − | + | − | N | Y | Y | |
| E3 | − | − | − | − | − | − | Splice defecte | Y | Y | N |
| p53−/− | ||||||||||
| F1 | Null | − | + | − | + | − | N | Y | Y | |
| F2 | Null | − | − | − | − | − | 1 | 1 | Y | |
| F3 | Null | − | + | ND | ND | ND | N | Y | Y | |
a
In the LOH column, − indicates lack of LOH in heterozygotes or absence of deletion in +/+ animals.
b
Y, yes; N, no; 1, no lesions of Ink4a/Arf locus detected, but lack of p19Arf overexpression despite p53 nullizygosity is consistent with a defective Ink4a/Arf locus.
c
ND, not done.
d
p16Ink4a protein is detected but migrates aberrantly at 9 to 11 kDa.
e
RT-PCR analysis detects transcripts from exon 1α and 1β but no products containing exons 2 and 3, suggesting defects in splicing or truncation of message.