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. 2006 Mar;74(3):1462–1470. doi: 10.1128/IAI.74.3.1462-1470.2006

TABLE 1.

Primer sequences for real-time RT-PCR

Primer Sequencea Annealing temp (°C)
RecA F, 5′-GTGGATCTATTGTATTAGATGAGG CTCTCG-3′ 60
R, 5′-GCCAAAGTTCTGCAACATTAACAC CTAAAG-3′
IFN-γ F, 5′-TACTGCCACGGCACAGTCATTGAA-3′ 60
R, 5′-GCAGCGACTCCTTTTCCGCTTCCT-3′
IL-10 F, 5′-AGAGCTGCGGACTGCCTTCA-3′ 60
R, 5′-AATGCTCCTTGATTTCTGGG-3′
TNF-α F, 5′-ATGAGCACAGAAAGCATGATC-3′ 60
R, 5′-TACAGGCTTGTCACTCGAATT-3′
IL-12p40 F, 5′-CGTTTATGTTGTAGAGGTGG-3′ 56.8
R, 5′-TGTGGAGCAGCAGATGTGAG-3′
IL-12p35 F, 5′-CCCTTGCCCTCCTAAACCAC-3′ 60
R, 5′-TAGTAGCCAGGCAACTCTCG-3′
GM-CSF F, 5′-CCCGCTCACCCATCACTGTC-3′ 60
R, 5′-CGGAGTTGGGGGGCAGTATG-3′
CXCL-1 F, 5′-GGCGCCTATCGCCAATGAGCTG-3′ 60
R, 5′-CTTGGGGACACCTTTTAGC-3′
CXCL-2 F, 5′-GGGTTGACTTCAAGAACATCCAGA-3′ 60
R, 5′-GGGCTTCAGGGTCAAGGCAAAC-3′
MCP-1 F, 5′-GCTGTTCACAGTTGCCGGCT-3′ 56.8
R, 5′-CATTAGCTTCAGATTTACGG-3′
RANTES F, 5′-CCCTCTGCACCCCCGTACCT-3′ 60
R, 5′-CCATTTTCCCAGGACCGAGT-3′
MIP-1α F, 5′-CTCAACATCATGAAGGTCTC-3′ 60
R, 5′-GGCATTCAGTTCCAGGTCAG-3′
MIP-1β F, 5′-CTCTCTCTCCTCTTGCTCGT-3′ 65.1
R, 5′-CTCCATGGGAGACACGCGTC-3′
a

F, forward; R, reverse.