TABLE 2.

Primers used in this study

Name	Sequence
Primers for sequencing
avsRI-F	5′-CTTTCGCCGCTGCCATGACC-3′
avsRI-R	5′-AACCGGCTCGATTCCCACAT-3′
Primers for site-directed mutagenesis
avsI-F	5′-CTCAGAGCTCTGAACAGCCGACATAAGCA-3′
avsI-R	5′-GACTCTAGAATGGCAATGTCACGAATGG-3′
avsI-int	5′-TGTCGCTACCGTCAGTTTTA-3′
avsR-F	5′-CAATGAGCTCCAACCTGTCCGGCTGTCTTTAC-3′
avsR-R	5′-AGATTCTAGAGATCACGGCGGTTTCCCAATA-3′
avsR-Int	5′-GTTTGACGATGACATTTATT-3′
ORF1-F1	5′-AACTGAGCTCGCCGAGCTTGCCCAGACACC-3′
ORF1-R1	5′-ATGCTCTAGACGGCATCGCGACCAAAATC-3′
ORF1-Int	5′-ATAAGATCGGCTCGGTTCA-3′
ORF2-F1	5′-CGCAGAGCTCCACCCTGACCGATCCGAAGAC-3′
ORF2-R1	5′-TGCATCTAGACATGCTGACCTTGCCGTTGATA-3′
ORF2-Int	5′-ATATCGACCAGACCTCCATC-3′
ORF3-F1	5′-GTAGGAGTCTGACATGGCTCCGGATTTCAC-3′
ORF3-R1	5′-ACGCTCTAGACTTCCAGCGTAGTCTTCTC-3′
Orf3-Int	5′-ATGCCTTGGCCTGTATCTCC-3′
PVIK165-P	5′-TACTCATCTTTGTTTCCTCC-3′
Primers for complementation
avsI-F1	5′-TAGAGAATTCCAATGCCTTCAAGACGGGGAGTG-3′
avsI-R1	5′-AGATCTGCAGTCAGGCGGCGCGTGCCTGTTCCA-3′
avsR-F1	5′-GTCTTCTAGACACTTTGGGTCTTTCGTATT-3′
avsR-R1	5′-CGGTGAGCTCTTATAATGGTGCTTCC-3′
Primers for lacZ fusion
avsRI-F1	5′-CACGGAGCTCTCTTATGTTAGCCAGACCTC-3′
avsRI-R1	5′-ATCTTCTAGACCTTAATTGGAAGGTGACACA-3′
Primers for RT-PCR
aviR-F	5′-TACGGCCTAGTGCGCAGTCCCAAAC-3′
aviR-R	5′-TCAGCTGATCAGGCCGAGACGA-3′
avhR-F	5′-GATATGGCGTCCCTGCTGTCGTC-3′
avhR-R	5′-CGGGTGGCGCGGTTGAGATAATG-3′
avsR-F2	5′-CTTTCGCCGCTGCCATGACC-3′
avsR-R2	5′-CCTTTGCCACCGCTTGAGT-3′
avsI-F2	5′-AGCCGACATAAGCAGACGCAACAG-3′
avsI-R2	5′-CGAAACATCCGCTCCAAAAACAC-3′
ORF1-F2	5′-GCCGAGCTTGCCCAGACACC-3′
ORF1-R2	5′-CGGCATCGCGACCAAAATC-3′
ORF2-F2	5′-CACCCTGACCGATCCGAAGACC-3′
ORF2-R2	5′-GCCGTCAGCTTGTCAAAATCATAG-3′
852-F	5′-GCTGCCAAGCGAAGTGATCCACA-3′
852-R	5′-TCCAGCAAAAGTCGAAGCGTTACAG-3′