TABLE 3.
Oligonucleotide | Sequencea | Cleavage site |
---|---|---|
B1-escC | 5′-AAAAAGCAGGCTGCTGCTATTTGTTTGACAGTGGCA-3′ | |
B2-escC | 5′-AGAAAGCTGGGTAACGTTACGTTTTTATCAAGAATCG-3′ | |
R1-escC | 5′-GAAGATCTTTACATTACACAATTCGTCCTA-3′ | BglII |
R2-escC | 5′-GAAGATCTTGAATGATGATTTCTCTGGCGA-3′ | BglII |
B1-escD | 5′-AAAAAGCAGGCTTCATGTTATCCTCATATAAAATTA-3′ | |
B2-escD | 5′-AGAAAGCTGGGTTTAATACGACAGTGGAATATGTA-3′ | |
R1-escD | 5′-CCGCTCGAGTGGAGTTTAATCCGTGGTTG-3′ | XhoI |
R2-escD | 5′-CCGCTCGAGCCGCAATTAATGATGTCTTAACG-3′ | XhoI |
B1-escJ | 5′-AAAAAGCAGGCTCATATCCCGTTAGCATCA-3′ | |
B2-escJ | 5′-AGAAAGCTGGGTTGGCAAAGATACCACTTC-3′ | |
R1-escJ | 5′-GAAGATCTTATTGCGCGAACTTAATCCTC-3′ | BglII |
R2-escJ | 5′-GAAGATCTAATACCCGGTGTTATCGATTG-3′ | BglII |
B1-espAcom | 5′-AAAAAGCAGGCTATTATAAGGAGGATGTTATGTG-3′ | |
B2-espAcom | 5′-AGAAAGCTGGGTCACAGACTGGATATCGTT-3′ | |
B1-escCcom | 5′-AAAAAGCAGGCTGATGCCGCCAACACACT-3′ | |
B2-escCcom | 5′-AGAAAGCTGGGTGGTCATTGAGATCTTGTTGTGTC-3′ | |
B1-escDcom | 5′-AAAAAGCAGGCTCATTAGCCATTGGAAACTCAC-3′ | |
B2-escDcom | 5′-AGAAAGCTGGGTGTATCCTGGTAATCAAGTCTCT-3′ | |
B1-escJcom | 5′-AAAAAGCAGGCTCATATCCCGTTAGCATCA-3′ | |
B2-escJcom | 5′-AGAAAGCTGGGTTGGCAAAGARACCACTTC-3′ | |
5GST-escC | 5′-CGGGATCCGCCCCGTCCTCTCTGGAA-3′ | BamHI |
3GST-escC | 5′-CGGAATTCTTATTCGCTAGATGCAGATTTTAT-3′ | EcoRI |
5GST-escJ | 5′-CGGGATCCTGATAAGAGCAATTGTATACAG-3′ | BamHI |
3GST-escJ | 5′-CGGAATTCTTACCCGTCCTGTCCTGAGGAT-3′ | EcoRI |
5GST-escD | 5′-AAAAAGCAGGCTTCATGTTATCCTCATATAAAATA-3′ | |
3GST-escD | 5′-AGAAAGCTGGGTTTAATACGACAGTGGAATATGTA-3′ | |
5GST-escF | 5′-AAAAAGCAGGCTTCCTGGAAGTTCTGTTCCAGGGGCCCATGAATTTATC TGAAATTAC-3′ | PreScission protease |
3GST-escF | 5′-AGAAAGCTGGGTTTAAAAACTACGGTTAGAAATG-3′ | |
R1V5HIS | 5′-GCGAGCTCACAAGTTTGTACAAAAAAGCTGAA-3′ | SacI |
R2V53 | 5′-GCTCTAGATTAACCGGTACGCGTAGAATCGAG-3′ | XbaI |
B1-escD-V5 | 5′-AAAAAGCAGGCTCCATATTTTTTCTCATTGTTCAACC-3′ | |
B2-escD-V5 | 5′-AGAAAGCTGGGTTATACGACAGTGGAATATGTATAGA-3′ | |
B1-escF-V5 | 5′-AAAAAGCAGGCTGTTCGTAATGAACGTAAATAGTTAA-3′ | |
B2-escF-V5 | 5′-AGAAAGCTGGGTTAAAACTACGGTTAGAAATGGTTGA-3′ |
Underlining indicates restriction enzyme sites or, for 5GST-escF, a region encoding a recognition site for PreScission protease.