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. 2006 Apr;188(8):2801–2811. doi: 10.1128/JB.188.8.2801-2811.2006

TABLE 3.

Oligonucleotides used in this study

Oligonucleotide Sequencea Cleavage site
B1-escC 5′-AAAAAGCAGGCTGCTGCTATTTGTTTGACAGTGGCA-3′
B2-escC 5′-AGAAAGCTGGGTAACGTTACGTTTTTATCAAGAATCG-3′
R1-escC 5′-GAAGATCTTTACATTACACAATTCGTCCTA-3′ BglII
R2-escC 5′-GAAGATCTTGAATGATGATTTCTCTGGCGA-3′ BglII
B1-escD 5′-AAAAAGCAGGCTTCATGTTATCCTCATATAAAATTA-3′
B2-escD 5′-AGAAAGCTGGGTTTAATACGACAGTGGAATATGTA-3′
R1-escD 5′-CCGCTCGAGTGGAGTTTAATCCGTGGTTG-3′ XhoI
R2-escD 5′-CCGCTCGAGCCGCAATTAATGATGTCTTAACG-3′ XhoI
B1-escJ 5′-AAAAAGCAGGCTCATATCCCGTTAGCATCA-3′
B2-escJ 5′-AGAAAGCTGGGTTGGCAAAGATACCACTTC-3′
R1-escJ 5′-GAAGATCTTATTGCGCGAACTTAATCCTC-3′ BglII
R2-escJ 5′-GAAGATCTAATACCCGGTGTTATCGATTG-3′ BglII
B1-espAcom 5′-AAAAAGCAGGCTATTATAAGGAGGATGTTATGTG-3′
B2-espAcom 5′-AGAAAGCTGGGTCACAGACTGGATATCGTT-3′
B1-escCcom 5′-AAAAAGCAGGCTGATGCCGCCAACACACT-3′
B2-escCcom 5′-AGAAAGCTGGGTGGTCATTGAGATCTTGTTGTGTC-3′
B1-escDcom 5′-AAAAAGCAGGCTCATTAGCCATTGGAAACTCAC-3′
B2-escDcom 5′-AGAAAGCTGGGTGTATCCTGGTAATCAAGTCTCT-3′
B1-escJcom 5′-AAAAAGCAGGCTCATATCCCGTTAGCATCA-3′
B2-escJcom 5′-AGAAAGCTGGGTTGGCAAAGARACCACTTC-3′
5GST-escC 5′-CGGGATCCGCCCCGTCCTCTCTGGAA-3′ BamHI
3GST-escC 5′-CGGAATTCTTATTCGCTAGATGCAGATTTTAT-3′ EcoRI
5GST-escJ 5′-CGGGATCCTGATAAGAGCAATTGTATACAG-3′ BamHI
3GST-escJ 5′-CGGAATTCTTACCCGTCCTGTCCTGAGGAT-3′ EcoRI
5GST-escD 5′-AAAAAGCAGGCTTCATGTTATCCTCATATAAAATA-3′
3GST-escD 5′-AGAAAGCTGGGTTTAATACGACAGTGGAATATGTA-3′
5GST-escF 5′-AAAAAGCAGGCTTCCTGGAAGTTCTGTTCCAGGGGCCCATGAATTTATC TGAAATTAC-3′ PreScission protease
3GST-escF 5′-AGAAAGCTGGGTTTAAAAACTACGGTTAGAAATG-3′
R1V5HIS 5′-GCGAGCTCACAAGTTTGTACAAAAAAGCTGAA-3′ SacI
R2V53 5′-GCTCTAGATTAACCGGTACGCGTAGAATCGAG-3′ XbaI
B1-escD-V5 5′-AAAAAGCAGGCTCCATATTTTTTCTCATTGTTCAACC-3′
B2-escD-V5 5′-AGAAAGCTGGGTTATACGACAGTGGAATATGTATAGA-3′
B1-escF-V5 5′-AAAAAGCAGGCTGTTCGTAATGAACGTAAATAGTTAA-3′
B2-escF-V5 5′-AGAAAGCTGGGTTAAAACTACGGTTAGAAATGGTTGA-3′
a

Underlining indicates restriction enzyme sites or, for 5GST-escF, a region encoding a recognition site for PreScission protease.