TABLE 5.
Polymorphism for those sites that were identified as fixed differences between one African (Lake Kariba) and one EuropeanD. melanogaster population for six “low variability” fragments
| LV fragment
|
||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 122 | 125 | 130 | 157 | 203 | 375a | |
| 4 | 02 | 44555 | 01 | 023 | 22 | |
| 7 | 36 | 36378 | 24 | 304 | 56 | |
| 5 | 46 | 76192 | 85 | 632 | 97 | |
| Africa | ||||||
| Kampala | C | GC | ATTTC | TC | GAG | CT |
| Kampala | . | .. | … | .. | TG. | .. |
| Kampala | . | .. | … | .. | TG. | .. |
| Kampala | . | .. | … | .. | … | .. |
| Kampala | . | .. | … | .. | … | .. |
| Kampala | . | .. | CCCAT | .. | .G. | .. |
| Kampala | G | .. | CCCAT | .. | … | .. |
| Kisoro | . | .. | … | .. | .G. | .. |
| Kisoro | . | .. | … | .. | TG. | .C |
| Kisoro | . | .. | … | .. | .G. | .. |
| Kisoro | . | .. | … | .. | … | .C |
| Kisoro | . | .. | CC… | .. | … | .. |
| Kisoro | G | .. | T… | .. | TG. | .C |
| Kisoro | G | A. | … | .. | .G. | .. |
| Kisoro | . | .. | … | .. | … | .. |
| Kisoro | . | .. | .C… | .. | .G. | .. |
| Kisoro | . | .. | .. | |||
| Kenya | G | TA | CCCAT | .. | .GC | .. |
| Kenya | . | .. | … | .. | ..T | .C |
| Kenya | . | .. | … | .. | … | .C |
| Kenya | . | T. | … | .. | .G. | .C |
| Kenya | . | .. | … | CT | TGC | .. |
| Kenya | . | .. | … | .. | TGC | TC |
| Kenya | . | .. | T… | .. | TG. | .. |
| Kenya | . | .. | T… | .. | … | .. |
| Kenya | . . | … | .T | TG. | TC | |
| Kenya | .. | .. | … | TC | ||
| Mali | . | .. | … | .. | .G. | .. |
| Mali | . | .. | … | .. | TGC | .. |
| Mali | . | .. | … | .. | TG . | .. |
| Mali | G | .. | CCCAT | .. | … | .. |
| Mali | . | A. | … | .. | TG. | .. |
| Mali | G | .. | T… | .. | … | .. |
| Mali | . | .. | … | CT | TG. | .. |
| Mali | G | .. | CCCAT | .. | TGC | .. |
| Mali | G | TA | CT | |||
| Sengwa | G | T. | … | .. | … | .. |
| Sengwa | . | .. | T… | .. | TGC | .. |
| Sengwa | . | TA | … | .. | .G. | .. |
| Sengwa | . | .. | T… | .. | … | .C |
| Sengwa | G | .. | CCCAT | .. | .G. | TC |
| Sengwa | . | TA | … | .. | T.. | .. |
| Sengwa | . | .. | CCCAT | .. | … | .C |
| Sengwa | . | .. | .T | … | .. | |
| Sengwa | . | .. | .. | … | .. | |
| Sengwa | .. | .. | .G. | .C | ||
| Lake Kariba | . | .. | … | .. | … | |
| Lake Kariba | . | A. | … | .. | … | |
| Lake Kariba | . | .. | … | .. | … | |
| Lake Kariba | . | A. | … | .. | … | |
| Lake Kariba | . | .. | … | .. | … | |
| Lake Kariba | . | .. | T… | .. | … | |
| Lake Kariba | . | .. | … | .. | … | |
| Lake Kariba | . | .. | … | .. | … | |
| Lake Kariba | . | .. | … | .. | … | |
| Lake Kariba | . | .. | … | .. | … | |
| Lake Kariba | . | .. | … | .. | … | |
| Lake Kariba | . | .. | T… | … | ||
| Europe | ||||||
| Leiden | G | TA | CCCAT | CT | TGC | TC |
| Leiden | G | TA | CCCAT | CT | TGC | TC |
| Leiden | G | TA | CCCAT | CT | TGC | TC |
| Leiden | G | TA | CCCAT | CT | TGC | TC |
| Leiden | G | TA | CCCAT | CT | TGC | TC |
| Leiden | G | TA | CCCAT | CT | TGC | TC |
| Leiden | G | TA | CCCAT | CT | TGC | TC |
| Leiden | G | TA | CCCAT | CT | TGC | TC |
| Leiden | G | TA | CCCAT | CT | TGC | TC |
| Leiden | G | TA | CCCAT | CT | TGC | TC |
| Leiden | G | TA | CCCAT | CT | TGC | TC |
| Leiden | TA | CCCAT | CT | TGC | ||
| D. simulans | . | .. | .A.A. | .. | .G. | .C |
The data for the Leiden and Lake Kariba populations were taken from Glinka et al. (2003).
a
The European sample for fragment 375 derives from Neumarkt, Germany.