TABLE 1.

Estimated direct effects of DU6i chromosomes on body weight and body weight gain

	Body weight									Body weight gain
21 days			42 days			63 days			21–42 days			42–63 days
Chromosome	Effect (g)	SE	P-value	Effect (g)	SE	P-value	Effect (g)	SE	P-value	Effect (g)	SE	P-value	Effect (g)	SE	P-value
1	0.42	0.14	0.003	1.29	0.32	<0.001	0.87	0.29	0.003	0.57	0.22	0.011	0.06	0.19	0.753
2	0.36	0.23	0.118	1.87	0.50	<0.001	2.68	0.44	<0.001	1.53	0.35	0.000	1.54	0.28	<0.001
3	0.80	0.16	<0.001	1.48	0.34	<0.001	1.12	0.32	<0.001	0.44	0.24	0.067	0.12	0.20	0.560
4	0.14	0.17	0.397	0.53	0.36	0.135	0.72	0.31	0.020	0.66	0.25	0.008	0.43	0.20	0.029
5	−0.12	0.18	0.504	1.18	0.41	0.004	1.77	0.36	<0.001	0.72	0.28	0.011	1.10	0.23	<0.001
6	0.27	0.11	0.012	0.73	0.23	0.002	0.15	0.22	0.489	0.33	0.16	0.040	−0.19	0.14	0.159
7	0.45	0.18	0.012	1.07	0.39	0.006	0.88	0.34	0.009	−0.09	0.27	0.751	0.01	0.21	0.959
8	0.33	0.15	0.031	0.96	0.33	0.004	0.91	0.32	0.005	0.49	0.23	0.035	0.36	0.20	0.074
9	−0.22	0.15	0.137	0.22	0.33	0.511	0.18	0.29	0.545	0.24	0.23	0.293	0.13	0.19	0.471
10	−0.19	0.18	0.289	−0.48	0.39	0.221	−0.28	0.34	0.408	−0.33	0.27	0.223	0.06	0.21	0.768
11	−0.21	0.23	0.379	1.45	0.51	0.005	1.79	0.44	<0.001	1.82	0.36	<0.001	0.68	0.28	0.015
12	0.12	0.14	0.386	0.36	0.31	0.245	0.20	0.28	0.469	0.12	0.22	0.592	0.04	0.18	0.841
13	0.36	0.15	0.016	1.06	0.33	0.001	0.89	0.30	0.003	0.33	0.23	0.145	0.02	0.19	0.933
14	0.33	0.13	0.010	0.28	0.28	0.326	0.66	0.26	0.009	−0.35	0.20	0.077	0.33	0.16	0.039
15	0.48	0.14	<0.001	1.37	0.31	<0.001	0.90	0.31	0.004	0.67	0.21	0.002	0.14	0.19	0.483
16	0.26	0.11	0.023	1.02	0.26	<0.001	0.51	0.24	0.037	0.54	0.18	0.003	−0.22	0.15	0.159
17	−0.35	0.13	0.009	0.64	0.30	0.033	1.00	0.28	<0.001	1.05	0.21	<0.001	0.71	0.18	<0.001
18	0.22	0.12	0.069	0.62	0.26	0.019	0.24	0.25	0.335	0.19	0.18	0.298	0.00	0.16	0.991
19	−0.37	0.16	0.020	−0.51	0.36	0.159	−0.53	0.33	0.116	−0.32	0.25	0.209	−0.04	0.21	0.833
All	3.08	0.46	<0.001	15.15	1.20	<0.001	14.69	1.03	<0.001	8.63	0.84	<0.001	5.28	0.67	<0.001
Y	−0.08	0.09	0.371	0.53	0.19	0.006	0.72	0.18	<0.001	0.80	0.13	<0.001	0.39	0.12	0.001

The effect is the estimated substitution effect of the DU6i chromosome vs. the DBA/2 chromosome. The P-value is given for the comparison between animals that are carriers of DU6i chromosomes vs. DBA/2 animals. P-values from bootstrapping can be found in supplemental Table 3 at http://www.genetics.org/supplemental/. Significant P-values <0.05 are in italics. SE, standard error.