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. 2006 May;80(10):5092–5096. doi: 10.1128/JVI.80.10.5092-5096.2006

TABLE 1.

Compositions of sequencing primers

Primer Sequence
H3F 5′-AGC AAA AGC AGG GGA TAA TTC T-3′
H3-490F 5′-CTG AAC GTG ACT ATG CCA-3′
H3-1046F 5′-GCG CAA TCG CAG GTT T-3′
H3-1507F 5′-GCA TAG GGT CAA TCA GAA-3′
H3-362R 5′-TAA GGG TAA CAG TTG CTG-3′
H3-792R 5′-CAG TAT GTC TCC CGG TTT-3′
HR 5′-AGT AGA AAC AAG GGT GTT TTT-3′
NAF 5′-AGC AAA AGC AGG AGT TTA AAA TG-3′
N1-409F 5′-GCA ACA ACA CTA AAC AAC AG-3′
N1-1144F 5′-ATT TGG GAT CCT AAT GGA TGG ACA G-3′
N1-547R 5′-GCA CTT GCT GAC CAA GCA ACT GAT T-3′
NAR 5′-AGT AGA AAC AAG GAG TTT TTT-3′
PB1-1 5′-TAT TCG TCT CAG GGA GCG AAA GCA GGC A-3′
PB1-F1 5′-GGT CGA ATG GTC TTAA CAG C-3′
PB1-R1 5′-GTT GCA GGT CCA AGA TCA TTG-3′
PB1-2341R 5′-ATA TCG TCT CGT ATT AGT AGA AAC AAG GCA TTT-3′
PB2-1 5′-TAT TCG TCT CAG GGA GCG AAA GCA GGT C-3′
PB2-F1 5′CCA CTG TGG ACC ATA TGG CC-3′
PB2-F2 5′-GAT CAA TGG TCC TGA GTC AG-3′
PB2-R1 5′-GCC TTC ATC CGG GTC TTT AG-3′
PB2-R2 5′-GCG ACA TCT CCG TGC TTG G-3′
PB2-2233R 5′-ATA TCG TCT CGT ATT AGT AGA AAC AAG GTA GTT-3′
PA-1 5′-TAT TCG TCT CAG GGA GCG AAA GCA GGT AC-3′
PA-F1 5′-GCA TTA CTG AAG CAC CGA TTT G-3′
PA-F2 5′-CTG GAG AGG AGA TGG CTA C-3′
PA-R1 5′-GCT CTC AAT CTG CTG AAG AG-3′
PA-R2 5′-CAG TAG CTC TGC AAT GGG ACA C-3′
PA-R3 5′-CTT CAT CAA GGG TGT AGT CTG C-3′
NP-1 5′-TAT TCG TCT CAG GGA GCA AAA GCA GGG TA-3′
NP-F1 5′-GAA GAG CAT CCC AGT GCT G-3′
NP-R1 5′-CCC TTT CAA AGT CAT GCC C-3′
NP-1565R 5′-ATA TCG TCT CGT ATT AGT AGA AAC AAG GGT ATT TTT-3′
NS-1 5′-TAT TCG TCT CAG GGA GCA AAA GCA GGG TG-3′
NS-890R 5′-ATA TCG TCT CGT ATT AGT AGA AAC AAG GGT GTT TT-3′
M-1 5′-TAT TCG TCT CAG GGA GCA AAA GCA GGT AG-3′
M-1027R 5′-ATA TCG TCT CGT ATT AGT AGA AAC AAG GTA GTT TTT-3′