Table 3.
PRISM | RSAT | Mitra | AlignACE | MS | BioProsp | MEME | Consensus | Weeder | YMF | |
BAS1 | 0.07 | 0.36 | 0.00 | 0.00 | 0.04 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.20 | 0.36 |
CPF1 | 0.62 | 0.00 | 0.00 | 0.54 | 0.00 | 0.62 | 0.48 | 0.00 | 0.47 | 0.44 |
CSRE | 0.09 | 0.25 | 0.00 | 0.10 | 0.00 | 0.49 | 0.30 | 0.00 | 0.08 | 0.07 |
GATA | 0.73 | 0.73 | 0.21 | 0.18 | 0.39 | 0.13 | 0.19 | 0.00 | 0.29 | 0.56 |
GCN4 | 0.50 | 0.29 | 0.02 | 0.26 | 0.28 | 0.00 | 0.02 | 0.00 | 0.37 | 0.29 |
GCR1 | 0.12 | 0.24 | 0.18 | 0.04 | 0.05 | 0.10 | 0.08 | 0.25 | 0.08 | 0.10 |
GLN3 | 0.00 | 0.00 | 0.02 | 0.79 | 0.00 | 0.00 | 0.05 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
HAP2 | 0.11 | 0.00 | 0.02 | 0.07 | 0.00 | 0.18 | 0.00 | 0.00 | 0.01 | 0.00 |
MATA1 | 0.19 | 0.10 | 0.26 | 0.17 | 0.00 | 0.49 | 0.12 | 0.00 | 0.06 | 0.13 |
MATA2 | 0.43 | 0.28 | 0.08 | 0.15 | 0.04 | 0.24 | 0.09 | 0.00 | 0.25 | 0.23 |
MCB | 0.69 | 0.62 | 0.02 | 0.40 | 0.48 | 0.05 | 0.26 | 0.51 | 0.50 | 0.64 |
MIG1 | 0.01 | 0.22 | 0.02 | 0.14 | 0.02 | 0.16 | 0.21 | 0.18 | 0.13 | 0.29 |
PDR3 | 0.71 | 0.46 | 0.51 | 0.76 | 0.75 | 0.42 | 0.37 | 0.73 | 0.82 | 0.74 |
PHO2 | 0.01 | 0.00 | 0.06 | 0.08 | 0.00 | 0.10 | 0.00 | 0.01 | 0.01 | 0.00 |
PHO4 | 0.25 | 0.21 | 0.24 | 0.23 | 0.00 | 0.21 | 0.33 | 0.23 | 0.00 | 0.18 |
RAP1 | 0.18 | 0.18 | 0.26 | 0.02 | 0.00 | 0.02 | 0.01 | 0.00 | 0.24 | 0.18 |
REB1 | 0.32 | 0.36 | 0.00 | 0.01 | 0.47 | 0.30 | 0.36 | 0.00 | 0.26 | 0.36 |
ROX1 | 0.19 | 0.33 | 0.05 | 0.05 | 0.00 | 0.09 | 0.45 | 0.00 | 0.17 | 0.18 |
RPA | 0.02 | 0.08 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.05 | 0.10 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
SCB | 0.69 | 0.52 | 0.58 | 0.08 | 0.00 | 0.09 | 0.40 | 0.00 | 0.57 | 0.50 |
SFF | 0.02 | 0.00 | 0.10 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
STE12 | 0.57 | 0.65 | 0.08 | 0.24 | 0.00 | 0.00 | 0.42 | 0.00 | 0.37 | 0.50 |
TBP | 0.00 | 0.00 | 0.03 | 0.00 | 0.19 | 0.02 | 0.02 | 0.00 | 0.00 | 0.01 |
UASCAR | 0.07 | 0.04 | 0.11 | 0.00 | 0.00 | 0.10 | 0.04 | 0.00 | 0.02 | 0.02 |
UASH | 0.01 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.01 | 0.00 |
UASPHR | 0.03 | 0.06 | 0.04 | 0.10 | 0.00 | 0.03 | 0.07 | 0.09 | 0.10 | 0.03 |
UIS | 0.16 | 0.00 | 0.03 | 0.00 | 0.00 | 0.09 | 0.02 | 0.10 | 0.09 | 0.01 |
URS1H | 0.60 | 0.42 | 0.62 | 0.00 | 0.50 | 0.75 | 0.41 | 0.46 | 0.38 | 0.40 |
Average Φ | 0.26 | 0.23 | 0.13 | 0.16 | 0.11 | 0.17 | 0.17 | 0.09 | 0.20 | 0.22 |
Wins | 6 | 1.5 | 3 | 2 | 2 | 6 | 2 | 1 | 1 | 1.5 |
# ≥ 0.50 | 8 | 4 | 3 | 3 | 1 | 2 | 0 | 2 | 3 | 5 |
# ≥ 0.33 | 9 | 9 | 3 | 4 | 5 | 5 | 7 | 3 | 7 | 9 |
# ≥ 0.10 | 17 | 17 | 10 | 12 | 7 | 14 | 13 | 6 | 14 | 17 |
clear win for PRISM | 8 | 11 | 11 | 14 | 9 | 12 | 13 | 10 | 8 | |
clear loss for PRISM | 5 | 0 | 2 | 2 | 4 | 3 | 2 | 3 | 2 |