TABLE 5.
Genotyper results, predicted serotype, and actual serotype for 93 clinical isolatesa
| Isolate PN code | Multiplex PCR result
|
Predicted serogroup and serotype | Actual serotype | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3M
|
19M
|
GPM
|
CPSA
|
||||||||||||
| 3 | 14 | 23F | IPC | 1 | 19F | IPC | 6 | 19 | 23 | IPC | cpsA | IPC | |||
| 1044 | − | − | − | + | − | − | + | + | − | − | − | + | − | GP-6 | 6B |
| 1124 | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | + | + | − | 14 | 14 |
| 1012 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 9V |
| 1019 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 9V |
| 1090 | − | − | − | + | − | − | + | + | − | − | − | + | − | GP-6 | 6B |
| 1094 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 5 |
| 1055 | − | − | − | + | − | − | + | + | − | − | − | + | − | GP-6 | 6B |
| 1127 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 9V |
| 1057 | − | − | + | − | − | − | + | − | − | + | − | + | − | GP-23, 23F | 23F |
| 1017 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 9V |
| 1099 | − | − | − | + | − | + | − | − | + | − | − | + | − | GP-19, 19F | 19F |
| 1104 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 9V |
| 1039 | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | + | + | − | 14 | 14 |
| 1035 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 9V |
| 1120 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 12 |
| 1103 | − | − | − | + | − | − | + | + | − | − | − | + | − | GP-6 | 6B |
| 1061 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 9V |
| 1074 | − | − | − | + | − | − | + | + | − | − | − | + | − | GP-6 | 6B |
| 1109 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 35F |
| 1112 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 4 |
| 1095 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 12 |
| 1043 | − | − | − | + | − | + | − | − | + | − | − | + | − | GP-19, 19F | 19F |
| 1020 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 9N |
| 1122 | − | − | − | + | − | − | + | + | − | − | − | + | − | GP-6 | 6A |
| 1081 | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | + | + | − | 14 | 14 |
| 1010 | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | + | + | − | 14 | 14 |
| 1001 | − | − | − | + | − | − | + | + | − | − | − | + | − | GP-6 | 6B |
| 1016 | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − | + | + | − | 1 | 1 |
| 1079 | − | − | − | + | − | − | + | + | − | − | − | + | − | GP-6 | 6B |
| 1013 | − | − | − | + | − | − | + | + | − | − | − | + | − | GP-6 | 6B |
| 1062 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 9V |
| 1014 | − | − | − | + | − | + | − | − | + | − | − | + | − | GP-19, 19F | 19F |
| 1091 | − | − | − | + | − | + | − | − | + | − | − | + | − | GP-19, 19F | 19F |
| 1018 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 9V |
| 1071 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 8 |
| 1111 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 20 |
| 1031 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 20 |
| 1101 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 18C |
| 1125 | + | − | − | − | − | − | + | − | − | − | + | + | − | 3 | 3 |
| 1108 | − | − | − | + | − | − | + | + | − | − | − | + | − | GP-6 | 6B |
| 1075 | − | − | − | + | − | + | − | − | + | − | − | + | − | GP-19, 19F | 19F |
| 1023 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 16F |
| 1085 | − | − | − | + | − | − | + | + | − | − | − | + | − | GP-6 | 6B |
| 1022 | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 15 |
| 1050 | − | − | − | + | − | + | − | − | + | − | − | + | − | GP-19, 19F | 19F |
| 1042 | − | − | − | + | − | − | + | + | − | − | − | + | − | GP-6 | 6B |
| 1106 | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | + | + | − | 14 | 14 |
| 1092 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 20 |
| 1076 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 29 |
| 1105 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 9V |
| 1033 | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | + | + | − | 14 | 14 |
| 1053 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 9V |
| 1021 | − | − | − | + | − | − | + | + | − | − | − | + | − | GP-6 | 6B |
| 1078 | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | + | + | − | 14 | 14 |
| 1097 | − | − | − | + | − | − | + | + | − | − | − | + | − | GP-6 | 6B |
| 1041 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 8 |
| 1045 | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | + | + | − | 14 | 14 |
| 1080 | − | − | − | + | − | − | + | + | − | − | − | + | − | GP-6 | 6A |
| 1003 | − | − | − | + | − | − | + | + | − | − | − | + | − | GP-6 | 6B |
| 1009 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 9V |
| 1054 | − | − | − | + | − | − | + | + | − | − | − | + | − | GP-6 | 6B |
| 1060 | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | + | + | − | 14 | 14 |
| 1040 | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | + | + | − | 14 | 14 |
| 1065 | − | − | − | + | − | + | − | − | + | − | − | + | − | GP-19, 19F | 19F |
| 1011 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 8/PICK> |
| 1100 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 9V |
| 1107 | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | + | + | − | 14 | 14 |
| 1059 | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | + | + | − | 14 | 14 |
| 1015 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 18C |
| 1093 | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | + | + | − | 14 | 14 |
| 1077 | − | − | − | + | − | − | + | + | − | − | − | + | − | GP-6 | 9V |
| 1028 | − | − | − | + | − | + | − | − | + | − | − | + | − | GP-19, 19F | 19F |
| 1025 | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | + | + | − | 14 | 14 |
| 1129 | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | + | + | − | 14 | 14 |
| 1052 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 9V |
| 1032 | + | − | − | − | − | − | + | − | − | − | + | + | − | 3 | 3 |
| 1066 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 9V |
| 1072 | − | − | − | + | − | − | + | + | − | − | − | + | − | GP-6 | 6B |
| 1130 | − | − | + | − | − | − | + | − | − | + | − | + | − | GP-23, 23F | 23F |
| 1046 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 9V |
| 1132 | − | − | − | + | − | − | + | + | − | − | − | + | − | GP-6 | 6B |
| 1008 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 8 |
| 1047 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 9V |
| 1068 | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | + | + | − | 14 | 14 |
| 1128 | − | − | + | − | − | − | + | − | − | + | − | + | − | GP-23, 23F | 23F |
| 1088 | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | + | + | − | 14 | 14 |
| 1049 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 35F |
| 1126 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 9V |
| 1083 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 9V |
| 1026 | − | − | − | + | − | + | − | − | + | − | − | + | − | GP-19, 19F | 19F |
| 1064 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 18C |
| 1067 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 12 |
| 1038 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | − | NP | 16F |
a
In the text, each isolate is identified by a code consisting of the two-letter prefix “PN” followed by a four-digit number; here, each isolate is identified solely by the four-digit number. +, positive PCR result; −, negative PCR result; GP, serogroup; NP, serogroup and serotype not predicted.