TABLE 1.
Origin and characteristics of the P. aeruginosa isolates
| AFLP type | Clonal complexa | Type isolate code | O serotypeb | No. of isolates | No. of patients | No. of isolates with the following origin:
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Antibiotic resistancec
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Resistance to topicals (zone size [mm])d
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Wound | Sputum | Throat | Nose | Urine | Blood | Other | Catheter | Probe | Environment | AMK | ATM | FEP | CAZ | CRO | CIP | IPM | MEM | PIP | TZP | TOB | FlamZ | FlamC | Sulfa | Isobet | Fura | ||||||
| 1 | G | Br678 | 11 | 11 | 3 | 5 | 4 | 2 | I | R | R | R | R | R | R | R | R* | R* | R | 20 | 16 | >30 | 19 | 9 | |||||||
| 2 | Br260 | 10 | 3 | 3 | 23 | 23 | >30 | 24 | 10 | ||||||||||||||||||||||
| 3 | Br599 | 10 | 5 | 3 | 1 | 1 | 3 | 17 | 15 | >30 | 17 | 12 | |||||||||||||||||||
| 4 | Br817 | 11 | 6 | 1 | 5 | 1 | 18 | 20 | >30 | 18 | 10 | ||||||||||||||||||||
| 5 | Br906 | 6 | 4 | 2 | 2 | 1 | 1 | 20 | 19 | >30 | 15 | 12 | |||||||||||||||||||
| 6 | Br262 | 11 | 1 | 1 | 20 | 25 | >30 | 20 | 8 | ||||||||||||||||||||||
| 7 | Br815 | NA | 1 | 1 | R | 21 | 22 | >30 | 24 | 14 | |||||||||||||||||||||
| 8 | Br735 | E | 76 | 19 | 47 | 2 | 5 | 6 | 5 | 1 | 1 | 7 | 2 | R* | 13 | 14 | >30 | 18 | 10 | ||||||||||||
| 9 | Br764 | 11 | 4 | 4 | 20 | 17 | >30 | 17 | 9 | ||||||||||||||||||||||
| 10 | Br230 | 11 | 1 | 1 | R | 19 | 21 | >30 | 20 | 10 | |||||||||||||||||||||
| 11 | Br750 | 11 | 1 | 1 | 1 | R | I | 18 | 13 | >30 | 22 | 20 | |||||||||||||||||||
| 12 | Br641 | 12 | 1 | 1 | R | 18 | 17 | >30 | 21 | 10 | |||||||||||||||||||||
| 13 | E | Br642 | 1 | 3 | 3 | R* | 19 | 18 | >30 | 18 | 10 | ||||||||||||||||||||
| 14 | G | Br692 | 11 | 4 | 1 | 4 | R | R | 20 | 17 | >30 | 20 | 9 | ||||||||||||||||||
| 15 | Br810 | 8 | 8 | 1 | 5 | 1 | 2 | I | 20 | 20 | >30 | 16 | 11 | ||||||||||||||||||
| 16 | Br908 | 8 | 1 | 1 | 1 | 20 | 20 | >30 | 15 | 10 | |||||||||||||||||||||
| 17 | Br220 | 1/13 | 1 | 1 | 21 | 25 | >30 | 16 | 22 | ||||||||||||||||||||||
| 18 | Br231 | 11 | 4 | 4 | R | 16 | 20 | >30 | 22 | 10 | |||||||||||||||||||||
| 19 | Br228 | NA | 1 | 1 | I | 15 | 20 | >30 | 22 | 8 | |||||||||||||||||||||
| 20 | Br826 | 6 | 1 | 1 | 1 | 22 | 22 | >30 | 18 | 9 | |||||||||||||||||||||
| 21 | Br607 | 8 | 2 | 1 | 2 | 21 | 21 | >30 | 17 | 10 | |||||||||||||||||||||
| 22 | Br811 | 9 | 9 | 1 | 4 | 1 | 3 | 1 | 18 | 21 | >30 | 14 | 8 | ||||||||||||||||||
| 23 | Br693 | 11 | 8 | 3 | 4 | 1 | 1 | 1 | 1 | I | R | 20 | 20 | >30 | 17 | 11 | |||||||||||||||
| 24 | Br617 | 9 | 1 | 1 | 1 | I | 20 | 22 | >30 | 16 | 10 | ||||||||||||||||||||
| 25 | Br816 | 6 | 2 | 1 | 1 | 1 | R | 20 | 20 | >30 | 18 | 11 | |||||||||||||||||||
| 26 | Br618 | 1 | 2 | 2 | 1 | 1 | 20 | 19 | >30 | 13 | 9 | ||||||||||||||||||||
| 27 | Br686 | 5 | 2 | 1 | 2 | 18 | 16 | >30 | 17 | 9 | |||||||||||||||||||||
| 28 | Br783 | 1 | 1 | 1 | 1 | 24 | 24 | >30 | 18 | 10 | |||||||||||||||||||||
| 29 | Br831 | 6 | 4 | 2 | 3 | 1 | 20 | 20 | >30 | 16 | 8 | ||||||||||||||||||||
| 30 | Br737 | 1 | 1 | 1 | 1 | 21 | 20 | >30 | 18 | 10 | |||||||||||||||||||||
| 31 | A | Br257 | 6 | 5 | 5 | 20 | 21 | >30 | 22 | 11 | |||||||||||||||||||||
| 32 | A | Br670 | 6 | 28 | 2 | 3 | 9 | 6 | 3 | 1 | 3 | 3 | R* | R | R* | R | R | R* | R* | 19 | 18 | >30 | 18 | 11 | |||||||
| 33 | A | Br776 | 6 | 15 | 2 | 1 | 3 | 4 | 2 | 3 | 2 | R* | R | R | R | 20 | 19 | >30 | 18 | 11 | |||||||||||
| 34 | Br217 | 6 | 1 | 1 | R | 17 | 23 | >30 | 20 | 10 | |||||||||||||||||||||
| 35 | C | Br667 | 12 | 131 | 29 | 59 | 18 | 9 | 9 | 10 | 3 | 1 | 11 | 3 | 6 | R* | I* | R | R* | R | R | R* | R* | R | R | R | 18 | 16 | >30 | 18 | 10 |
| 36 | Br840 | NA | 1 | 1 | 19 | 22 | >30 | 17 | 12 | ||||||||||||||||||||||
| 37 | Br261 | 6 | 1 | 1 | 22 | 23 | >30 | 22 | 8 | ||||||||||||||||||||||
| 38 | Br890 | 3 | 4 | 2 | 3 | 1 | I | 21 | 20 | >30 | 14 | 10 | |||||||||||||||||||
| 39 | Br219 | 1/13 | 1 | 1 | R | 20 | 24 | >30 | 20 | 15 | |||||||||||||||||||||
| 40 | Br639 | NA | 1 | 1 | 1 | I | 20 | 20 | >30 | 20 | 14 | ||||||||||||||||||||
| 41 | Br221 | NA | 1 | 1 | R | 20 | 25 | >30 | 22 | 16 | |||||||||||||||||||||
| 42 | Br680 | 12 | 1 | 1 | 1 | 21 | 24 | >30 | 15 | 10 | |||||||||||||||||||||
| 43 | Br763 | 11 | 3 | 3 | 19 | 23 | >30 | 16 | 10 | ||||||||||||||||||||||
| 44 | Br218 | 6 | 1 | 1 | I | 23 | 27 | >30 | 20 | 10 | |||||||||||||||||||||
| 45 | Br225 | 11/PA | 2 | 2 | R | 21 | 22 | >30 | 20 | 20 | |||||||||||||||||||||
| 46 | Br227 | 11 | 1 | 1 | R | 16 | 24 | >30 | 20 | 8 | |||||||||||||||||||||
| 47 | Br223 | NA | 1 | 1 | R | R | >30 | >30 | >30 | >30 | 26 | ||||||||||||||||||||
| 48 | Br700 | NA | 1 | 1 | 1 | 18 | 17 | >30 | 21 | 13 | |||||||||||||||||||||
a
According to Pirnay et al. (42).
b
PA, polyagglutination; NA, no agglutination.
c
R, resistant; I, intermediate; blank cell, susceptible; *, acquired during this study; AMK, amikacin; ATM, aztreonam; FEP, cefepime; CAZ, ceftazidime; CRO, ceftriaxone; CIP, ciprofloxacin; IPM, imipenem; MEM, meropenem; PIP, piperacillin; TZP, piperacillin-tazobactam; TOB, tobramycin.
d
Mean zone of inhibition. FlamZ, Flammazine (1% SSD); FlamC, Flammacerium (1% SSD plus 2.2% cerium nitrate); Sulfa, Sulfamylon (8.5% mafenide acetate); Isobet, Isobetadine cream (10% povidone-iodine); Fura, Furacine (0.2% nitrofurazone).