Table 2.
Strongest nucleotide associations in 23-RSS
| Correlated positions | Associated nucleotides | Count | Frequency |
| 19:27:30:31:32:33:37 | T:G:T:C:A:G:C | 16 | 0.108 |
| C:C:T:A:C:C:A | 12 | 0.081 | |
| A:C:A:A:C:A:A | 9 | 0.061 | |
| G:C:G:A:C:A:A | 8 | 0.054 | |
| C:C:T:A:C:A:A | 6 | 0.041 | |
| T:T:A:A:C:A:A | 6 | 0.041 | |
| C:C:C:A:C:A:A | 5 | 0.034 | |
| T:G:T:C:A:G:T | 5 | 0.034 | |
| A:C:A:G:C:A:A | 4 | 0.027 | |
| A:C:C:A:C:A:A | 4 | 0.027 | |
| A:C:C:A:T:A:A | 4 | 0.027 | |
| T:G:T:C:A:G:A | 4 | 0.027 | |
| A:C:T:A:C:A:A | 3 | 0.020 | |
| G:G:T:C:A:G:A | 3 | 0.020 | |
| C:C:T:G:C:A:A | 3 | 0.020 | |
| C:T:A:A:C:T:A | 3 | 0.020 | |
| T:C:T:A:C:A:A | 3 | 0.020 | |
| A:T:A:A:C:A:A | 2 | 0.014 | |
| C:A:A:A:C:A:A | 2 | 0.014 | |
| C:A:C:C:T:C:G | 2 | 0.014 | |
| C:C:C:A:C:C:A | 2 | 0.014 | |
| C:C:T:A:A:C:A | 2 | 0.014 | |
| C:C:T:A:C:T:A | 2 | 0.014 | |
| C:C:T:C:C:T:A | 2 | 0.014 | |
| C:C:T:T:C:A:A | 2 | 0.014 | |
| T:G:T:A:C:A:A | 2 | 0.014 | |
| T:C:G:A:C:A:A | 2 | 0.014 | |
| T:C:T:T:A:C:A | 2 | 0.014 | |
| T:T:A:C:T:A:C | 2 | 0.014 | |
| A:A:G:G:A:C:G | 1 | 0.007 | |
| A:G:C:A:G:A:A | 1 | 0.007 | |
| A:C:G:C:A:C:T | 1 | 0.007 | |
| A:C:T:G:C:A:A | 1 | 0.007 | |
| A:T:G:A:C:A:A | 1 | 0.007 | |
| A:T:T:A:C:A:A | 1 | 0.007 | |
| G:C:A:G:C:G:A | 1 | 0.007 | |
| G:C:G:A:A:A:A | 1 | 0.007 | |
| G:C:G:C:C:C:A | 1 | 0.007 | |
| G:C:C:A:C:A:A | 1 | 0.007 | |
| G:C:T:A:A:G:A | 1 | 0.007 | |
| G:C:T:G:C:A:A | 1 | 0.007 | |
| G:C:T:C:T:C:A | 1 | 0.007 | |
| G:T:A:C:A:A:C | 1 | 0.007 | |
| C:C:A:C:A:A:C | 1 | 0.007 | |
| C:C:G:A:C:A:A | 1 | 0.007 | |
| C:C:T:A:T:G:A | 1 | 0.007 | |
| C:T:A:G:C:A:A | 1 | 0.007 | |
| C:T:C:A:C:A:A | 1 | 0.007 | |
| T:G:T:C:A:C:C | 1 | 0.007 | |
| T:G:T:T:A:G:C | 1 | 0.007 | |
| T:C:C:A:C:A:A | 1 | 0.007 | |
| T:C:T:G:C:A:A | 1 | 0.007 | |
| T:T:G:G:C:A:A | 1 | 0.007 | |
| T:T:G:C:A:G:C | 1 | 0.007 | |
| T:T:G:T:C:A:A | 1 | 0.007 | |
| 8:09:21 | T:T:C | 34 | 0.222 |
| A:G:G | 24 | 0.157 | |
| C:T:T | 21 | 0.137 | |
| G:T:C | 7 | 0.046 | |
| G:T:G | 6 | 0.039 | |
| A:G:T | 5 | 0.033 | |
| T:G:G | 5 | 0.033 | |
| T:T:A | 5 | 0.033 | |
| A:C:G | 4 | 0.026 | |
| A:T:T | 4 | 0.026 | |
| G:C:G | 4 | 0.026 | |
| T:G:T | 4 | 0.026 | |
| C:T:A | 3 | 0.020 | |
| T:C:C | 3 | 0.020 | |
| T:C:T | 3 | 0.020 | |
| T:T:G | 3 | 0.020 | |
| A:C:A | 2 | 0.013 | |
| G:C:C | 2 | 0.013 | |
| C:T:G | 2 | 0.013 | |
| T:C:A | 2 | 0.013 | |
| T:T:T | 2 | 0.013 | |
| A:G:A | 1 | 0.007 | |
| A:C:T | 1 | 0.007 | |
| A:T:A | 1 | 0.007 | |
| A:T:G | 1 | 0.007 | |
| A:T:C | 1 | 0.007 | |
| G:A:C | 1 | 0.007 | |
| C:T:C | 1 | 0.007 | |
| T:G:A | 1 | 0.007 | |
| 7:24:25 | G:A:G | 65 | 0.419355 |
| G:A:A | 24 | 0.154839 | |
| G:G:A | 11 | 0.070968 | |
| G:C:C | 11 | 0.070968 | |
| G:C:A | 6 | 0.03871 | |
| A:A:G | 5 | 0.032258 | |
| G:A:C | 5 | 0.032258 | |
| G:T:G | 4 | 0.025806 | |
| C:T:C | 4 | 0.025806 | |
| C:T:T | 3 | 0.019355 | |
| A:A:A | 2 | 0.012903 | |
| A:C:T | 2 | 0.012903 | |
| A:T:T | 2 | 0.012903 | |
| G:G:G | 2 | 0.012903 | |
| T:T:C | 2 | 0.012903 | |
| A:C:C | 1 | 0.006452 | |
| A:T:A | 1 | 0.006452 | |
| A:T:G | 1 | 0.006452 | |
| G:T:A | 1 | 0.006452 | |
| G:T:C | 1 | 0.006452 | |
| T:G:A | 1 | 0.006452 | |
| T:T:T | 1 | 0.006452 |
Details as in Table 1.