TABLE 1.

Ligation probes for OLA (5′ to 3′)

Protein	Position	Target amino acidb	Codon	Ligation probea
				Capture	Reporter
ParC	79	Ser	TCT	TTCCACCCACACGGGGATTC	TTCTATCTATGATGCCATGGTTC
		Tyr	TAT	TTCCACCCACACGGGGATTA	TTCTATCTATGATGCCATGGTTC
		Phe	TTT	TTCCACCCACACGGGGATTT	TTCTATCTATGATGCCATGGTTC
		Ala	GCT	TTCCACCCACACGGGGATGC	TTCTATCTATGATGCCATGGTTC
	83	Asp	GAT	CGGGGATTCTTCTATCTATG	ATGCCATGGTTCGTATGTCT
		Tyr	TAT	CGGGGATTCTTCTATCTATT	ATGCCATGGTTCGTATGTCT
		Asn	AAT	CGGGGATTCTTCTATCTATA	ATGCCATGGTTCGTATGTCT
		His	CAT	CGGGGATTCTTCTATCTATC	ATGCCATGGTTCGTATGTCT
		Gly	GGT	CGGGGATTCTTCTATCTATG	GTGCCATGGTTCGTATGTCT
		Val	GTT	CGGGGATTCTTCTATCTATG	TTGCCATGGTTCGTATGTCT
GyrA	84	Ser	TCC	TATCACCCACACGGGGATTC	CTCTATTTATGAAGCCATGGTCC
		Phe	TTC	TATCACCCACACGGGGATTT	CTCTATTTATGAAGCCATGGTCC
		Ala	GCC	TATCACCCACACGGGGATGC	TCTATTTATGAAGCCATGGTCC
		Tyr	TAC	TATCACCCACACGGGGATTA	TCTATTTATGAAGCCATGGTCC
		Cys	TGC	TATCACCCACACGGGGATTG	TCTATTTATGAAGCCATGGTCC
	88	Glu	GAA	ACACGGGGATTACTCTATTTATG	AAGCCATGGTCCGTATGGCT
		Lys	AAA	ACACGGGGATTACTCTATTTATA	AAGCCATGGTCCGTATGGCT
		Gly	GGA	ACACGGGGATTACTCTATTTATG	GAGCCATGGTCCGTATGGCT

^aCapture probes are labeled with biotin on the 5′ end. Reporter probes are phosphorylated on the 5′ end and labeled with digoxigenin on the 3′ end.

^bFor each position, the wild-type amino acid is given first.