TABLE 1.
LiPA type | No. of specimens with TRUGENE 5′NC type:
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1 | 1a | 1b | 1c | 2 | 2a | 2b | 3 | 3a | 3c | 4 | 4a | 4e | 4g | 4f | 5a | 6a | NTb | Total | |
1a | 3 | 50 | 1 | 54 | |||||||||||||||
1b | 8 | 3 | 32 | 1 | 44 | ||||||||||||||
1a/b | 2 | 10 | 1 | 13 | |||||||||||||||
1a, 1b | 1 | 3 | 4 | ||||||||||||||||
2 | 1 | 1 | 2 | ||||||||||||||||
2a/c | 1 | 6 | 7 | ||||||||||||||||
2b | 9 | 9 | |||||||||||||||||
3a | 4 | 14 | 1 | 19 | |||||||||||||||
4 | 1 | 1 | |||||||||||||||||
4c/d | 4 | 1 | 5 | ||||||||||||||||
4h | 1 | 1 | |||||||||||||||||
5a | 7 | 7 | |||||||||||||||||
6a | 5 | 5 | |||||||||||||||||
NT | 1 | 1 | |||||||||||||||||
Total | 14 | 66 | 33 | 2 | 7 | 0 | 10 | 4 | 14 | 1 | 4 | 1 | 1 | 1 | 1 | 7 | 5 | 1 | 172 |
Specimens with agreement at the subtype level are underlined, and the specimen with disagreement at the genotype level is in boldface.
NT, not typeable.