TABLE 1.
PCR primers used for conventional 16S rRNA gene sequencing
| Strain no. | Primer
|
|
|---|---|---|
| Forward | Backward | |
| 1 | LPW55 5′-AGTTTGATCCTGGCTCAG-3′ | LPW58 5′-AGGCCCGGGAACGTATTCAC-3′ |
| 2 | LPW55 5′-AGTTTGATCCTGGCTCAG-3′ | LPW58 5′-AGGCCCGGGAACGTATTCAC-3′ |
| 3 | LPW81 5′-TGGCGAACGGGTGAGTAA-3′ | LPW58 5′-AGGCCCGGGAACGTATTCAC-3′ |
| 4 | LPW200 5′-GAGTTGCGAACGGGTGAG-3′ | LPW205 5′-CTTGTTACGACTTCACCC-3′ |
| 5 | LPW200 5′-GAGTTGCGAACGGGTGAG-3′ | LPW205 5′-CTTGTTACGACTTCACCC-3′ |
| 6 | LPW200 5′-GAGTTGCGAACGGGTGAG-3′ | LPW205 5′-CTTGTTACGACTTCACCC-3′ |
| 7 | LPW200 5′-GAGTTGCGAACGGGTGAG-3′ | LPW205 5′-CTTGTTACGACTTCACCC-3′ |
| 8 | LPW200 5′-GAGTTGCGAACGGGTGAG-3′ | LPW205 5′-CTTGTTACGACTTCACCC-3′ |
| 9 | LPW200 5′-GAGTTGCGAACGGGTGAG-3′ | LPW205 5′-CTTGTTACGACTTCACCC-3′ |
| 10 | LPW200 5′-GAGTTGCGAACGGGTGAG-3′ | LPW205 5′-CTTGTTACGACTTCACCC-3′ |
| 11 | LPW200 5′-GAGTTGCGAACGGGTGAG-3′ | LPW205 5′-CTTGTTACGACTTCACCC-3′ |
| 12 | LPW200 5′-GAGTTGCGAACGGGTGAG-3′ | LPW205 5′-CTTGTTACGACTTCACCC-3′ |
| 13 | LPW398 5′-GGCGTGCTTACCACATG-3′ | LPW58 5′-AGGCCCGGGAACGTATTCAC-3′ |
| 14 | LPW398 5′-GGCGTGCTTACCACATG-3′ | LPW58 5′-AGGCCCGGGAACGTATTCAC-3′ |
| 15 | LPW55 5′-AGTTTGATCCTGGCTCAG-3′ | LPW58 5′-AGGCCCGGGAACGTATTCAC-3′ |
| 16 | LPW55 5′-AGTTTGATCCTGGCTCAG-3′ | LPW325 5′-CGGATACCTTGTTACGACT-3′ |
| 17 | LPW55 5′-AGTTTGATCCTGGCTCAG-3′ | LPW282 5′-GCTTCGGGTGTYRCCAACTTTC-3′ |
| 18 | LPW55 5′-AGTTTGATCCTGGCTCAG-3′ | LPW205 5′-CTTGTTACGACTTCACCC-3′ |
| 19 | LPW55 5′-AGTTTGATCCTGGCTCAG-3′ | LPW325 5′-CGGATACCTTGTTACGACT-3′ |
| 20 | LPW55 5′-AGTTTGATCCTGGCTCAG-3′ | LPW325 5′-CGGATACCTTGTTACGACT-3′ |
| 21 | LPW55 5′-AGTTTGATCCTGGCTCAG-3′ | LPW325 5′-CGGATACCTTGTTACGACT-3′ |
| 22 | LPW55 5′-AGTTTGATCCTGGCTCAG-3′ | LPW325 5′-CGGATACCTTGTTACGACT-3′ |
| 23 | LPW81 5′-TGGCGAACGGGTGAGTAA-3′ | LPW324 5′-TTGTTACGACTTCACCCCA-3′ |
| 24 | LPW55 5′-AGTTTGATCCTGGCTCAG-3′ | LPW58 5′-AGGCCCGGGAACGTATTCAC-3′ |
| 25 | LPW55 5′-AGTTTGATCCTGGCTCAG-3′ | LPW58 5′-AGGCCCGGGAACGTATTCAC-3′ |
| 26 | LPW55 5′-AGTTTGATCCTGGCTCAG-3′ | LPW58 5′-AGGCCCGGGAACGTATTCAC-3′ |
| 27 | LPW81 5′-TGGCGAACGGGTGAGTAA-3′ | LPW307 5′-TAGCGATTCCGACTTCAT-3′ |
| 28 | LPW55 5′-AGTTTGATCCTGGCTCAG-3′ | LPW58 5′-AGGCCCGGGAACGTATTCAC-3′ |
| 29 | LPW55 5′-AGTTTGATCCTGGCTCAG-3′ | LPW182 5′-AGTCGCTGATTCCACTGTGG-3′ |
| 30 | LPW55 5′-AGTTTGATCCTGGCTCAG-3′ | LPW182 5′-AGTCGCTGATTCCACTGTGG-3′ |
| 31 | LPW55 5′-AGTTTGATCCTGGCTCAG-3′ | LPW182 5′-AGTCGCTGATTCCACTGTGG-3′ |
| 32 | LPW55 5′-AGTTTGATCCTGGCTCAG-3′ | LPW58 5′-AGGCCCGGGAACGTATTCAC-3′ |
| 33 | LPW55 5′-AGTTTGATCCTGGCTCAG-3′ | LPW58 5′-AGGCCCGGGAACGTATTCAC-3′ |
| 34 | LPW81 5′-TGGCGAACGGGTGAGTAA-3′ | LPW58 5′-AGGCCCGGGAACGTATTCAC-3′ |
| 35 | LPW81 5′-TGGCGAACGGGTGAGTAA-3′ | LPW58 5′-AGGCCCGGGAACGTATTCAC-3′ |
| 36 | LPW81 5′-TGGCGAACGGGTGAGTAA-3′ | LPW58 5′-AGGCCCGGGAACGTATTCAC-3′ |
| 37 | LPW81 5′-TGGCGAACGGGTGAGTAA-3′ | LPW58 5′-AGGCCCGGGAACGTATTCAC-3′ |