TABLE 6.
Likelihood-ratio test P-value for significance of LD
| Class I
|
Class II
|
Class I/II
|
|||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Population | A:B | C:B | A:C | DRB1:DQB1 | DRB1:DPB1 | DQB1:DPB1 | A:DRB1 | A:DQB1 | A:DPB1 | C:DRB1 | C:DQB1 | C:DPB1 | B:DRB1 | B:DQB1 | B:DPB1 |
| Dogon | 0.000 | 0.000 | 0.000 | ||||||||||||
| Kenyan | 0.000 | 0.000 | 0.000 | ||||||||||||
| Shona | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.003 | 0.001 | 0.000 | 0.490 | 0.000 | 0.000 | 0.002 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| Zulu | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.013 | |||||||||
| Czech | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.129 | 0.422 | 0.010 | 0.697 | 0.034 | 0.000 | 0.000 | 0.101 | 0.000 | 0.000 | 0.015 |
| Georgian | 0.030 | 0.000 | 0.097 | ||||||||||||
| Irish | 0.000 | 0.000 | 0.000 | ||||||||||||
| Slovenian | 0.000 | 0.102 | 0.012 | ||||||||||||
| Kinh | 0.000 | ||||||||||||||
| Malay | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.716 | 0.081 | 0.002 | 0.038 | 0.373 | 0.004 | 0.213 | 0.519 | 0.178 | 0.221 | 0.127 |
| Muong | 0.000 | ||||||||||||||
| Puyuma | 0.000 | 0.000 | 0.000 | ||||||||||||
| Saisiat | 0.000 | 0.000 | 0.001 | ||||||||||||
| Yami | 0.000 | 0.000 | 0.000 | ||||||||||||
| Korean | 0.000 | 0.000 | 0.000 | ||||||||||||
| Okinawan | 0.000 | 0.000 | 0.000 | ||||||||||||
| Tuva | 0.000 | 0.000 | 0.000 | ||||||||||||
| East Timorese | 0.000 | 0.274 | 0.002 | ||||||||||||
| Filipino | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||||||||
| Ivatan | 0.000 | 0.000 | 0.000 | ||||||||||||
| Moluccan | 0.000 | 0.000 | 0.000 | ||||||||||||
| PNG Lowlander | 0.000 | ||||||||||||||
| Cape York | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||||||||
| Kimberley | 0.000 | 0.067 | 0.020 | ||||||||||||
| Yuendumu | 0.000 | 0.000 | 0.000 | ||||||||||||
| Canoncito | 0.000 | 0.001 | 0.004 | ||||||||||||
| Mixe | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.937 | 0.851 | 0.006 | 0.002 | 0.297 | 0.000 | 0.000 | 0.079 | 0.001 | 0.000 | 0.289 |
| Yupik | 0.000 | 0.000 | 0.000 | ||||||||||||
| Zuni | 0.000 | 0.000 | 0.329 | ||||||||||||
| Central America | 0.000 | 0.000 | 0.051 | ||||||||||||
| Guarani–Nandewa | 0.007 | 0.000 | 0.017 | 0.000 | 0.004 | 0.022 | 0.000 | 0.008 | 0.000 | 0.006 | |||||
Uncorrected P-values are listed. Italic values indicate P-values <0.05 after correcting for the number of populations for a locus pair (i.e., in a column).