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. 2006 Sep;174(1):465–480. doi: 10.1534/genetics.106.058792

TABLE 4.

Structure of the Thr-Gly repeat

Repeat Sequence
TG24a a b c c - - - d d d d d e f d2 - - - - - - - -g c - h d g h d h h h - d1 h
TG24b a b c c c - - - d d d d e f d4 - - - - - - - -g c - h d g h d h h h - d1 h
TG24c a b c c c c - - - d d d e f d - - - - - - - -g c - h d g h d h h h - d1 h
TG24d a b c c - - - d d d d d e f d - - - - - - - -g c - h d g h d h h h - d1 h
TG24e a b c c c2 - - - - d d d e f d - - - - - - - - g c h1 h - g h d h h h - d1 h
TG24f a b c c c - - - d d d d e f d - - - - - - - -g c - h d g h d h h h - d1 h1
TG24g a b c c - - - - d d d d e f d - - - - - - - - g c - h d g h d h h h h d1 h
TG24h a b c - c2 - - d d d d d e f d4 - - - - - - - g c - h d g - d h h h h - h
TG24i a b c c c - - - d d d d e f d - - - - - - - g c - h d g h d h h h - d1 h
TG24j a b c c c - - - - - d d d e f d - - - - - - - g c h1 h d g h d h h h - d1 h
TG23a a b c c - - - - - - d d d e f d e f d e f d g c - - - - - - - - h h h - d h
TG23b a b c c c - - - - - d d d e f d - - - - - - - g c - h d g h d h h h - d1 h
TG23c a b c c c - - - - d d d e f d - - - - - - - - g c - h d g h d h h h - d1 h1
TG23d a b c c - - - - d d d d e f d4 - - - - - - - - g c - h d g h d h h h - d1 h
TG23e a b c c c - - -d d d d e f d - - - - - - - - g c - h d g h d h h2 - - d1 h
TG23f a b c c - - - -d d d d3 e f d - - - - - - - - g c - h d g h d h h h - d1 h
TG23g a b c c - - - - - d d d e f d - - - - - - - - g c h1 h d g h d h h h - d1 h
TG22a a b c c - - - - - d d d e f d - - - - - - - - - g c - h d g h d h h h - d1 h
TG22b a b c c c - - - - d d d e f d - - - - - - - - -g c - h d g h d h h2 h - - h
TG22c a b c c - - - - - d d d e f d e f - - - - - - - - - - h d g h d3 h h h - d h
TG22d a b c c c - - - - - d d e f d - - - - - - - - - g c c h d g h3 d h h - d1 h
TG22e a b c c - - - - - d d d e f d e f d - - - - - g c h h - - h d h- - - d1 h
TG22f a b c c c c c - d d d e f d - - - - - - - - - g c h1h d g h d h - - - - - -
TG22g a b c c - - - - - d d d e f d4 - - - - - - - - g c - h d4 g h d h h h - d1 h
TG22h a b c c - - - - d d d d e f d - - - - - - - - g c - h d g h d h h - - d1 h
TG22i a b c c c - - - - - d d e f d - - - - - - - - g c h1h d g h d h h - - -d1h
TG21a a b c c - - - - - d d d e f d e f d - - - - - g c - - - - - - - - -h h h h d h
TG21b a b c c - - - - - - d d e f d2 - - - - - - - - -g c - h d g h d h h - h d1 h
TG21c a b c c - - - - - - d d e f d4 - - - - - - - - -g c – h d g h d h h h - d1 h
TG20a a b c c - - - - - d d d e f d e f d - - - - - g c - - - - - - - - - -h h h d h
TG20b a b c1 c - - - - -d d d e1f d e - d - - - g g c - - - - - - - - - -h h h d1h
TG20c a b c c - - - - - d d d e f d e f d - - - - - g c - - - - - - - - - -h h h d1 h
TG20d a b c c - - - - - - d d e f d4 - - d - - - - - - -c – h d g h d h h - - - d1h
TG20e a b c c c - - - - d d d e f d - - - - - - - - g c h1h d g h - - - - - - - d h
TG18a a b c c c - - - - d d d e f d - - - - - - - - g c - - - - - - - - - - h h h d h
TG18b a b c c - - - - - d d d e f d - - - - - - - - g c - - - - - - - - - h h h h d h
TG18c a b c c - - - - - d d d e f d e f d - - - - -g c - - - - - - - - - - - - - h d h
TG18d a b c c - - - - - d d d e f d4 - - - - - - - -g c - h d - h d h - - - - h
TG17a a b c c - - - - - d d d e f d - - - - - - - - g c - - - - - - - - - - - h h h d h
TG17b a b c c - - - - - d d d e1 f d - - - - - - - -g c - - - - - - - - - - - h h h d h
TG17c a b c c - - - - - d d d1 e f d - - - - - - - -g c - - - - - - - - - - - h h h d h
TG14 a b c c c - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - d g h d - - h h h d1 h

Each letter represents a Thr-Gly encoding hexameric cassette. If any of the cassettes have a synonymous substitution they are given a subscript indicating their possible common mode of decent. a, ACGGGC; b, ACTGGT; c, ACAGGT; c1, ACAGGA; c2, ACTGGT; d, ACTGGA; d1, ACTGGC; d2, ACAGGC; d3, ACTGGT; d4, ACTGGG; e, ACCGGG; e1, ACAGGG; f, ACAGGA; g, ACGGGA; h, ACAGGC; h1, ACAGGT; h2, ACGGGC; h3, ACAGGG.