TABLE 4.
Repeat | Sequence |
---|---|
TG24a | a b c c - - - d d d d d e f d2 - - - - - - - -g c - h d g h d h h h - d1 h |
TG24b | a b c c c - - - d d d d e f d4 - - - - - - - -g c - h d g h d h h h - d1 h |
TG24c | a b c c c c - - - d d d e f d - - - - - - - -g c - h d g h d h h h - d1 h |
TG24d | a b c c - - - d d d d d e f d - - - - - - - -g c - h d g h d h h h - d1 h |
TG24e | a b c c c2 - - - - d d d e f d - - - - - - - - g c h1 h - g h d h h h - d1 h |
TG24f | a b c c c - - - d d d d e f d - - - - - - - -g c - h d g h d h h h - d1 h1 |
TG24g | a b c c - - - - d d d d e f d - - - - - - - - g c - h d g h d h h h h d1 h |
TG24h | a b c - c2 - - d d d d d e f d4 - - - - - - - g c - h d g - d h h h h - h |
TG24i | a b c c c - - - d d d d e f d - - - - - - - g c - h d g h d h h h - d1 h |
TG24j | a b c c c - - - - - d d d e f d - - - - - - - g c h1 h d g h d h h h - d1 h |
TG23a | a b c c - - - - - - d d d e f d e f d e f d g c - - - - - - - - h h h - d h |
TG23b | a b c c c - - - - - d d d e f d - - - - - - - g c - h d g h d h h h - d1 h |
TG23c | a b c c c - - - - d d d e f d - - - - - - - - g c - h d g h d h h h - d1 h1 |
TG23d | a b c c - - - - d d d d e f d4 - - - - - - - - g c - h d g h d h h h - d1 h |
TG23e | a b c c c - - -d d d d e f d - - - - - - - - g c - h d g h d h h2 - - d1 h |
TG23f | a b c c - - - -d d d d3 e f d - - - - - - - - g c - h d g h d h h h - d1 h |
TG23g | a b c c - - - - - d d d e f d - - - - - - - - g c h1 h d g h d h h h - d1 h |
TG22a | a b c c - - - - - d d d e f d - - - - - - - - - g c - h d g h d h h h - d1 h |
TG22b | a b c c c - - - - d d d e f d - - - - - - - - -g c - h d g h d h h2 h - - h |
TG22c | a b c c - - - - - d d d e f d e f - - - - - - - - - - h d g h d3 h h h - d h |
TG22d | a b c c c - - - - - d d e f d - - - - - - - - - g c c h d g h3 d h h - d1 h |
TG22e | a b c c - - - - - d d d e f d e f d - - - - - g c h h - - h d h- - - d1 h |
TG22f | a b c c c c c - d d d e f d - - - - - - - - - g c h1h d g h d h - - - - - - |
TG22g | a b c c - - - - - d d d e f d4 - - - - - - - - g c - h d4 g h d h h h - d1 h |
TG22h | a b c c - - - - d d d d e f d - - - - - - - - g c - h d g h d h h - - d1 h |
TG22i | a b c c c - - - - - d d e f d - - - - - - - - g c h1h d g h d h h - - -d1h |
TG21a | a b c c - - - - - d d d e f d e f d - - - - - g c - - - - - - - - -h h h h d h |
TG21b | a b c c - - - - - - d d e f d2 - - - - - - - - -g c - h d g h d h h - h d1 h |
TG21c | a b c c - - - - - - d d e f d4 - - - - - - - - -g c – h d g h d h h h - d1 h |
TG20a | a b c c - - - - - d d d e f d e f d - - - - - g c - - - - - - - - - -h h h d h |
TG20b | a b c1 c - - - - -d d d e1f d e - d - - - g g c - - - - - - - - - -h h h d1h |
TG20c | a b c c - - - - - d d d e f d e f d - - - - - g c - - - - - - - - - -h h h d1 h |
TG20d | a b c c - - - - - - d d e f d4 - - d - - - - - - -c – h d g h d h h - - - d1h |
TG20e | a b c c c - - - - d d d e f d - - - - - - - - g c h1h d g h - - - - - - - d h |
TG18a | a b c c c - - - - d d d e f d - - - - - - - - g c - - - - - - - - - - h h h d h |
TG18b | a b c c - - - - - d d d e f d - - - - - - - - g c - - - - - - - - - h h h h d h |
TG18c | a b c c - - - - - d d d e f d e f d - - - - -g c - - - - - - - - - - - - - h d h |
TG18d | a b c c - - - - - d d d e f d4 - - - - - - - -g c - h d - h d h - - - - h |
TG17a | a b c c - - - - - d d d e f d - - - - - - - - g c - - - - - - - - - - - h h h d h |
TG17b | a b c c - - - - - d d d e1 f d - - - - - - - -g c - - - - - - - - - - - h h h d h |
TG17c | a b c c - - - - - d d d1 e f d - - - - - - - -g c - - - - - - - - - - - h h h d h |
TG14 | a b c c c - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - d g h d - - h h h d1 h |
Each letter represents a Thr-Gly encoding hexameric cassette. If any of the cassettes have a synonymous substitution they are given a subscript indicating their possible common mode of decent. a, ACGGGC; b, ACTGGT; c, ACAGGT; c1, ACAGGA; c2, ACTGGT; d, ACTGGA; d1, ACTGGC; d2, ACAGGC; d3, ACTGGT; d4, ACTGGG; e, ACCGGG; e1, ACAGGG; f, ACAGGA; g, ACGGGA; h, ACAGGC; h1, ACAGGT; h2, ACGGGC; h3, ACAGGG.