Table 1.
Primers Used for Study
| Oligo name | Sequence 5′→3′ | Conc. in PCR (nmol/L) | Purpose | Software design |
|---|---|---|---|---|
| AS005 | CAAACAGCCCAGTTACAATTACATTAG | 200 | pagA gene primer | Primer express |
| AS006 | FAM-TXAATCCAGGAATCCTGCTCCATC | 200 | pagA gene primer | Primer express |
| AS007 | CAGATAATGCATCGCTTGCTTTAG | 200 | capB gene primer | Primer express |
| AS008 | HEX-TXGGATGAGCATTCAACATACCACG | 200 | capB gene primer | Primer express |
| MM698 | HEX-XGATAATGCATCGCTTGCTTTAG | 150 | capB gene primer | Visual OMP |
| MM699 | GCTGTTTCCTCATCAATCCC | 150 | capB gene primer | Visual OMP |
| PN 1143 | FAM-TXCATGTCGGGGGCATATAAC | 100 | cya gene primer | Primer 3 |
| PN 1144 | TGCACCTGACCATAGAACG | 100 | cya gene primer | Primer 3 |
| PN 1323 | FAM-XCCTGCTCCATCTGATAATACTCTA | 100 | pagA gene primer | Visual OMP |
| PN 1324 | AGCAGGCAAGGACAGTG | 100 | pagA gene primer | Visual OMP |
| PN 1139 | Cy5-TXGCCTGCTGTGCTGTGT | 100 | IPC primer | Primer 3 |
| PN 1140 | TCGTGCGGTGCGTC | 100 | IPC primer | Primer 3 |
| PN 1141 | HEX-TXGCGCCGTAAAGAAGGTC | 150 | capB gene primer | Primer 3 |
| PN 1142 | CTACCCTGCGTTGCTCA | 150 | capB gene primer | Primer 3 |
Conc., concentration; X, 5-methyl-isocytosine.