TABLE 2.
Sequence analysis of the 29 isolates found to harbor the blaTEM gene by PCRa
| Speciesa (no. of isolates) | Amino acid at positionb:
|
β-Lacta- mase | ||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4 | 5 | 6 | 21 | 39 | 42 | 51 | 69 | 92 | 104 | 115 | 127 | 130 | 153 | 164 | 165 | 182 | 196 | 204 | 218 | 237 | 238 | 240 | 244 | 262 | 265 | 268 | 275 | 276 | ||
| EC (5) | S | I | Q | L | Q | A | L | M | G | E | D | I | S | H | R | W | M | G | R | G | A | G | E | R | V | T | S | R | N | TEM-1 |
| KP (5) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| KO (1) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| OK (1) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| OE (2) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| EC (1) | K | TEM-2 | ||||||||||||||||||||||||||||
| OE (6) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| OK (2) | S | TEM-12 | ||||||||||||||||||||||||||||
| OE (1) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| EC (1) | L | TEM-33 | ||||||||||||||||||||||||||||
| OE (2) | L | D | TEM-35 | |||||||||||||||||||||||||||
| KP (1) | F | S | M | TEM-102 | ||||||||||||||||||||||||||
| OE (1) | ||||||||||||||||||||||||||||||
a
EC, E. coli; KP, K. pneumoniae; KO, K. oxytoca; OK, other species of Klebsiella; OE, other species of Enterobacteriaceae.
b
Amino acid residues are numbered according to the numbering system of Ambler et al. (1). The one-letter amino acid code is used as follows: A, alanine; C, cysteine; D, aspartic acid; E, glutamic acid; F, phenylalanine; G, glycine; H, histidine; I, isoleucine; K, lysine; L, leucine; M, methionine; N, asparagine; P, proline; Q, glutamine; R, arginine; S, serine; T, threonine; V, valine; W, tryptophan.