Table 1.
Sequence variation and lineage identification of 32 M. myotis and M. blythii analysed for 308 bp of mtDNA HVII. Haplotypes H1–H43 have already been reported in M. myotis (see Ruedi & Castella 2003), while H58–H75 are new variants. (Dots represent the same nucleotide as in H1, and hyphens represent indels. Only variations of the initial 180 bp are shown here, but the full length table is available in the electronic supplementary material.)
| polymorphic positions | |||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 1 | 1 | 5 | 6 | 7 | 9 | 9 | 9 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | |||||
| 0 | 3 | 4 | 7 | 9 | 6 | 8 | 1 | 2 | 5 | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 4 | 4 | 5 | 6 | 6 | 7 | 7 | 7 | |||||
| species | origin | field number | haplo-type | haplo-group | 8 | 9 | 1 | 2 | 3 | 4 | 0 | 5 | 6 | 9 | 1 | 5 | 3 | 7 | 8 | ||||||||||
| M. myotis | Bulgaria | BSM13, 14 | H1 | A | G | A | A | A | T | T | G | T | T | G | — | T | A | A | A | C | A | T | A | A | A | G | A | T | G |
| M. myotis | Bulgaria | BSM4 | H33 | A | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | — | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| M. myotis | Greece | M749 | H1 | A | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | — | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| M. blythii | Spain | M122, 135 | H1 | A | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | — | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| M. blythii | Spain | MbB | H27 | A | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | — | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| M. blythii | Spain | M165 | H63 | A | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | — | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| M. blythii | Spain | M235 | H64 | A | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | — | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| M. blythii | Spain | M265 | H65 | A | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | — | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| M. blythii | France | V46, 47 | H1 | A | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | — | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| M. blythii | France | EMC—3 | H27 | A | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | — | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| M. blythii | Italy | M634 | H13 | C | · | · | · | · | · | · | · | C | · | A | — | C | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | C | T |
| M. blythii | Italy | Pi40 | H15 | C | · | · | · | G | · | · | · | C | · | A | — | . | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · |
| M. blythii | Italy | M633 | H66 | C | · | · | · | G | · | · | · | C | · | A | — | . | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | C | A |
| M. blythii | Italy | Pi95 | H69 | C | · | · | · | · | · | · | · | C | · | A | — | C | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | C | T |
| M. blythii | France | EMC—2 | H62 | C | · | · | · | G | · | · | · | C | · | A | — | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | C | · |
| M. myotis | Greece | M752 | H34 | D | A | · | · | · | · | · | · | C | · | A | — | · | · | G | · | · | · | · | · | G | G | · | · | · | · |
| M. blythii | Greece | M759, 760 | H34 | D | A | · | · | · | · | · | · | C | · | A | — | · | · | G | · | · | · | · | · | G | G | · | · | · | · |
| M. myotis | Bulgaria | BSM3 | H35 | D | A | · | · | · | · | · | · | C | · | A | — | · | · | G | · | · | · | · | · | G | G | · | · | · | · |
| M. myotis | Bulgaria | BSM1 | H58 | D | A | · | · | · | · | · | · | C | · | A | — | · | · | G | · | · | G | · | · | G | G | · | · | · | · |
| M. blythii | Bulgaria | BSMb10 | H59 | D | A | · | · | · | · | · | · | C | · | A | — | · | · | G | · | · | · | · | · | G | G | · | · | · | A |
| M. blythii | Bulgaria | BSMb12 | H61 | D | A | · | · | · | · | · | · | C | · | A | — | · | · | G | · | · | · | · | · | G | G | · | · | · | · |
| M. blythii | Bulgaria | BSMb11 | H60 | F | · | · | G | · | · | · | · | C | · | A | — | · | · | G | · | · | · | · | G | G | G | · | · | · | · |
| M. blythii | Greece | M819 | H67 | F | · | G | G | · | · | · | · | C | · | A | — | . | · | G | · | · | · | · | G | G | G | · | · | · | · |
| M. blythii | Greece | M839 | H68 | F | · | · | G | · | · | · | · | C | · | A | — | . | · | G | · | · | · | · | G | G | G | · | · | · | · |
| M. blythii | Kirghiztan | Mb1 | H72 | Kgz | A | · | G | · | C | C | · | C | · | A | C | C | G | G | G | T | · | C | T | · | · | A | G | · | A |
| M. blythii | Kirghiztan | Mb2 | H73 | Kgz | A | · | G | · | C | C | A | C | · | A | C | C | G | G | G | T | · | C | T | · | · | · | G | · | A |
| M. blythii | Kirghiztan | Mb4 | H74 | Kgz | A | · | · | · | C | C | A | C | · | A | C | C | G | G | G | T | · | C | T | · | · | A | G | · | A |
| M. blythii | Kirghiztan | Mb5 | H75 | Kgz | A | · | · | · | C | C | A | C | · | A | C | C | G | G | G | T | · | C | T | · | · | A | G | · | A |