Table 2. Assigned sequence distribution.
Wolf | Cheetah | Hippopotamus | Lion | Saiga | Gibbon | Narwhal | Domestic Mouse | Musk Ox | Human | Zebra | African Buffalo | Impala | |||||
Primer | Canis lupus | Acinonyx jubatus | Hippopotamus amphibius | Panthera leo | Saiga tartarica | Hylobates muelleri | Monodon monoceros | Mus domesticus | Ovibos moschatus | Homo sapiens | Equus burchelli | Syncerus caffer | Aepyceros melampus | Total | Correctly assigned | Incorrectly assigned | Assignment Error |
16FAA | 49 | 69 | 23 | 1 | 142 | 141 | 1 | 0.0071 | |||||||||
16RAA | 41 | 58 | 16 | 115 | 115 | 0 | 0.0000 | ||||||||||
16FAC | 58 | 98 | 23 | 179 | 179 | 0 | 0.0000 | ||||||||||
16RAC | 21 | 72 | 20 | 1 | 114 | 113 | 1 | 0.0088 | |||||||||
16FAG | 15 | 17 | 36 | 68 | 68 | 0 | 0.0000 | ||||||||||
16RAG | 20 | 17 | 28 | 65 | 65 | 0 | 0.0000 | ||||||||||
16FAT | 28 | 44 | 23 | 1 | 96 | 95 | 1 | 0.0105 | |||||||||
16RAT | 18 | 56 | 19 | 93 | 93 | 0 | 0.0000 | ||||||||||
16FTA | 13 | 64 | 49 | 1 | 127 | 127 | 0 | 0.0000 | |||||||||
16RTA | 7 | 39 | 40 | 1 | 0 | 87 | 86 | 1 | 0.0116 | ||||||||
16FTC | 28 | 47 | 19 | 1 | 19 | 114 | 113 | 1 | 0.0088 | ||||||||
16RTC | 32 | 58 | 7 | 1 | 14 | 112 | 111 | 1 | 0.0090 | ||||||||
16FTG | 12 | 57 | 31 | 5 | 105 | 105 | 0 | 0.0000 | |||||||||
16RTG | 19 | 55 | 12 | 1 | 87 | 87 | 0 | 0.0000 | |||||||||
16FTT | 15 | 54 | 35 | 6 | 110 | 110 | 0 | 0.0000 | |||||||||
16RTT | 21 | 48 | 27 | 4 | 1 | 101 | 100 | 1 | 0.0100 | ||||||||
16FGA | 1 | 86 | 42 | 43 | 19 | 191 | 190 | 1 | 0.0053 | ||||||||
16RGA | 1 | 65 | 54 | 34 | 9 | 163 | 162 | 1 | 0.0062 | ||||||||
16FGC | 8 | 64 | 42 | 4 | 118 | 118 | 0 | 0.0000 | |||||||||
16RGC | 5 | 63 | 25 | 11 | 104 | 104 | 0 | 0.0000 | |||||||||
16FGG | 84 | 51 | 31 | 25 | 191 | 191 | 0 | 0.0000 | |||||||||
16RGG | 61 | 61 | 24 | 26 | 172 | 172 | 0 | 0.0000 | |||||||||
16FGT | 90 | 43 | 45 | 24 | 202 | 202 | 0 | 0.0000 | |||||||||
16RGT | 71 | 46 | 35 | 9 | 161 | 161 | 0 | 0.0000 | |||||||||
16FCA | 1 | 71 | 86 | 80 | 238 | 237 | 1 | 0.0042 | |||||||||
16RCA | 1 | 54 | 96 | 81 | 232 | 231 | 1 | 0.0043 | |||||||||
16FCC | 106 | 93 | 106 | 305 | 305 | 0 | 0.0000 | ||||||||||
16RCC | 2 | 117 | 108 | 101 | 328 | 326 | 2 | 0.0061 | |||||||||
16FCG | 1 | 80 | 99 | 112 | 292 | 291 | 1 | 0.0034 | |||||||||
16RCG | 96 | 82 | 108 | 286 | 286 | 0 | 0.0000 | ||||||||||
16FCT | 3 | 86 | 93 | 84 | 266 | 263 | 3 | 0.0114 | |||||||||
16RCT | 1 | 82 | 102 | 74 | 259 | 258 | 1 | 0.0039 | |||||||||
16SF4A | 43 | 2 | 45 | 45 | 0 | 0.0000 | |||||||||||
16SR4A | 55 | 5 | 60 | 60 | 0 | 0.0000 | |||||||||||
16SF4B | 29 | 2 | 15 | 4 | 50 | 48 | 2 | 0.0417 | |||||||||
16SR4B | 25 | 19 | 6 | 50 | 50 | 0 | 0.0000 | ||||||||||
16SF4C | 51 | 60 | 3 | 114 | 114 | 0 | 0.0000 | ||||||||||
16SR4C | 43 | 54 | 3 | 100 | 100 | 0 | 0.0000 | ||||||||||
Total | 5642 | 5622 | 20 | 0.1525 | |||||||||||||
Mean | 148.5 | 147.9474 | 0.5263 | 0.0040 | |||||||||||||
Percent GS20 sequences | 83.4 | 83.1 | |||||||||||||||
Overall miss-assignment rate | 0.003557453 | ||||||||||||||||
Analysis by Column: | SUM | MEAN | |||||||||||||||
Correctly Assigned | 398 | 431 | 188 | 147 | 422 | 220 | 470 | 424 | 279 | 127 | 988 | 782 | 746 | 5622 | 432.46 | ||
Incorrect assigned | 0 | 1 | 0 | 0 | 2 | 1 | 2 | 1 | 0 | 11 | 0 | 2 | 0 | 20 | 1.5385 | ||
Species assignment error | 0.0000 | 0.0023 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0047 | 0.0045 | 0.0043 | 0.0024 | 0.0000 | 0.0866 | 0.0000 | 0.0026 | 0.0000 | 0.0083 |
Italic numbers indicate miss-assigned sequences.