TABLE 1.
Prevalence of the minor clones and sporadic isolates included in this study relative to other clones found in previous studiesa
| Country and strain | Clonal type | Prevalence (%) | Source or referenceb |
|---|---|---|---|
| Portugal | |||
| HSA10 | III::α::A | 2 | 5 |
| HSA49 | V::NH::B | 1 | 5 |
| HGSA9 | XI::B::g | 3 | 5 |
| HGSA128 | XI::NH::D1 | 1 | 5 |
| NA | Iberian | 29 | 5 |
| NA | Brazilian | 56 | 5 |
| NA | Other | 8 | 5 |
| IPOP2 | II::NA::D2 | 23 | L |
| NA | Brazilian | 60 | L |
| NA | Other | 17 | L |
| Italy | |||
| ITL262 | II::NH::E | 12 | M |
| ITL592 | II::E::F | 38 | M |
| ITL113 | II::E::G | 3 | M |
| NA | Iberian | 29 | M |
| NA | Brazilian | 13 | M |
| NA | Other | 5 | M |
| Turkey | |||
| TUR4 | II::ηη::H | 39 | L |
| TUR9 | III::A::I | 15 | L |
| TUR1 | III::A::J | 3 | L |
| TUR27 | II::D::I | 3 | L |
| NA | Other | 40 | L |
| Greece | |||
| GRE14 | II::NH::K | 9 | 1 |
| GRE120 | II::E::L | 1 | 1 |
| GRE108 | III::B::M | 1 | 1 |
| NA | Brazilian | 60 | 1 |
| NA | EMRSA-16 | 29 | 1 |
| Czech Republic | |||
| CR1 | II::NH::P | 2 | 23 |
| CR43 | I::NH::O | 2 | 23 |
| NA | Iberian | 12 | 23 |
| NA | Brazilian | 80 | 23 |
| NA | Other | 4 | 23 |
| Poland | |||
| PLN49 | II::NH::N | 3 | 20 |
| NA | Polish | 75 | 20 |
| NA | Other | 22 | 20 |
| Chile | |||
| CHL5 | II::E′::Q | 43 | 4 |
| CHL63 | II::E′::Q | 43 | |
| NA | Brazilian | 57 | 4 |
| Colombia | |||
| COBIII | II::NH::R | 1 | 18 |
| NA | Pediatric | 99 | 18 |
| Argentina | |||
| ARG33 | II::E::S | 6 | 4, 7 |
| ARG127 | II::NH::T | <1 | 4, 7 |
| ARG229 | I::NH::U | <1 | 4, 7 |
| ARG199 | I::NH::V | <1 | 4, 7 |
| ARG64 | II::EE::X | <1 | 4, 7 |
| ARG105 | II::E::W | 1 | 4, 7 |
| AGT42 | IX::OO::Y | 1 | 4, 7 |
| AGT30 | XI::E::W | 1 | 4, 7 |
| AGT55 | IX::E::a | 1 | 4, 7 |
| NA | Brazilian | 70 | 4, 7 |
| NA | Pediatric | 11 | 4, 7 |
| NA | Other | 5 | 4, 7 |
| Brazil | |||
| BZ40 | I::E::C | 1 | 4 |
| BZ48 | III:B::E | 1 | 4 |
| BZ14 | II::E::F | 1 | 4 |
| NA | Brazilian | 97 | 4 |
| Japan | |||
| JP84 | I::J::b | 1 | 3 |
| JP82 | I′::NH::c | 1 | 3 |
| JP87 | I::A::d | 1 | 3 |
| JP26 | I::A::e | 1 | 3 |
| JP238 | I::A::f | 1 | 3 |
| NA | NY/Japan | 92 | 3 |
| NA | Other | 3 | 3 |
| Taiwan | |||
| TAW97 | XI::B::C | 3 | 2 |
| TAW214 | II::NH::h | 1.5 | 2 |
| TAW166 | II::ZZ::i | 1.5 | 2 |
| NA | Hungarian | 94 | 2 |
a
NA, not available (that is, clonal types not included in this study).
b
L, H. de Lencastre et al., unpublished data; M, R. Mato et al., unpublished data.