Skip to main content
. 2006 Dec 28;75(3):1255–1264. doi: 10.1128/IAI.01484-06

TABLE 1.

Primers for S. iniae 9117 capsule genes

Primer Sequence (5′-3′)
deoD 5′ CCT GGT GAG ATT GCT GAT AAA ATT CTT CTT CC
deoD 3′ GGT TTC AAG GCC AAC TTG CAT CAT GTC AGT GAA GG
hk 5′ CCT AAA TGA GAG GAT TGA AGA AGA GC
hk 3′ GCT TGT GAC GAG AAA TGT GTG GTA CG
cpsY 5′ TCC CCC CGG GTT ACG CTA GAC AAA TCA TTG AAC AAA CC
cpsY 3′ AAC TGC AGT TAA AAA GTG ACG CAC GGT CAC TAA CG
cpsA 5′ GAG TTA AAA CTT GAA GAA GTT TGC TTC TTA TCC
cpsA 3′ CCT AGC ATA TCA ATT AAG TTC AAA AAG G
cpsB 5′ CGA ACC ATT GTT TCA ACA TCT CAC AGA CG
cpsB 3′ CGT CAC ATG TTG ATA AGC TTC TTG C
cpsC 5′ GCT ACT AGC TGG TTT TTT AGC CTT GGT GG
cpsC 3′ GGA TAA CTG CAA ATA TAC TTA AAA CAG C
cpsD 5′ CCT GGT GAA GGA AAG TCA ACC ACA TCG
cpsD 3′ GCA CAA AAC GAC GTT TAA TAG AAC CTG C
cpsE 5′ CCA TCT TTC AGC CTA TGC TTT TTT AAT GG
cpsE 3′ GCT TAC TCC TGT TTA GCG TCA TTT ATT AAG G
cpsF 5′ GCA TGT ATC CTT ATA TTA AAC GAC TAT TAG C
cpsF 3′ CCT TAT TTT GCT CTG GTC CAC CCT CTA AGA CG
cpsG 5′ GGT GCA AAT TCT TAT ATA GGA ACT TCC
cpsG 3′ CCG ATA TTC GTA TTG ACT CTT CAA ATC C
cpsH 5′ GGA GCA GAC GTT ATT TCT TTG ATG AAC G
cpsH 3′ CCT GTT TAA TCC CTA AAG TAT CGT ATA ACC
cpsI 5′ GCT TAC AAA AAT TTT TTT CAA AAA AGC TCG
cpsI 3′ GCT GGT GAT CCT ATT GCA ATT GAA TTT GCT GG
cpsJ 5′ GGT GCA AAT GGA TAC TTA GGA AAA GGT GTC G
cpsJ 3′ GCT TTT CAA CTT TTC TGA ATT CCC CCA TAC TGC
cpsK 5′ GAT AAC TGT TTG TAT GGC AAC TTT TAA TGG
cpsK 3′ CCT CTT GTT GTT TTT TAC AGT TAG TCC
orf276 5′ CGT GCA GTT TAT ATT AGG CAT ATG ATT CC
orf276 3′ GGA ACA CAT TCT TCA ACT CTA GC
orf193 5′ GGT CAA TAG TAT TAA GTT GTA TAT TAC TAC
orf193 3′ CCT AAA AAA ACA ATC ATC ATC ATA ATG CC
orf151 5′ GGA ATT TTC TCT AAC AAA TTT TCA ATT C
orf151 3′ GGA TTA ATT GAA TCT AAA TAA AAC G
cpsL 5′ CGT TTT ATT TAG ATT CAA TTA ATC C
cpsL 3′ CGA ACA TAT TTG TAA AAT TGT ATT GGT GG
orf-1 5′ GCT ACT CAA AAG AAT TTA AAG AAA CC
orf-1 3′ GCT AAA GTT TGT ATG GTT TGA GCC ATA TCC
orf-2 5′ GGA TAT GGC TCA AAC CAT ACA AAC TTT AGC
orf-2 3′ CCT TTT CAA ATT GAT TAG GTG TAA GAT ACC
cpsM 5′ CGA CTC CAT ATC TAT CAA GGG TTT TAT CG
cpsM 3′ CAG CAA CTG CTA TTT TTT TCA TGG TAT CC
cpsN 5′ CCA TGA AAA AAA TAG CAG TTG CTG GTA CG
cpsN 3′ CCA AGA CAC TCG GAT TAA TCC CGG CCG AAA AGG
orf183 5′ GGT CGA AAG AAC TCC ACT ATC TTA GG
orf183 3′ GCA GTT GTT AAT GAC TGT ATT AGA CTT CC