TABLE 2.
Primers used in this study
| Primer | Sequencea |
|---|---|
| 63f | 5′-CAGGCCTAACACATGCAAGTC-3′ |
| 1387r | 5′-GGGCGGWGTGTACAAGGC-3′ |
| gfpF1 | 5′-CGCGGATCCTTTAAGAAGGAGATATACATATGAGTAAAGGAGAAG-3′ |
| gfpR1 | 5′-AAACTGCAGGAATTCTTATTTGTATAGTTC-3′ |
| 66EHf | 5′-CCTGCTAATTGGTAATACC-3′ |
| 66EHr | 5′-CGGAAATGTTGAATACTCATAC-3′ |
| D1 | 5′-CGGGGTACCTTACCAGCAGATGCGG-3′ |
| D2 | 5′-CGGGGTACCCAGGATCGACAAGCGAC-3′ |
| D3 | 5′-CGGGGTACCCTAAATTTAAAGAAAACACTTGC-3′ |
| D4 | 5′-CGGGGTACCCGGATTTCCTATTAAATTTGTG-3′ |
| D5 | 5′-CGGGGTACCCTAATTATTATGAACAAATCAG-3′ |
| D6 | 5′-CGGGGTACCGCTATCGCTGCTGATGCAGG-3′ |
| D7 | 5′-CGGGGTACCGCTGCAGCTAAATTAGC-3′ |
| gfpSphIR | 5′-ACATGCATGCGAATTCTTATTTGTATAGTTC-3′ |
| RBSM1 | 5′-CGCGGATCCAATTAATAATTCGTTTTTATGAGTAAAGGAGAAG-3′ |
| RBSM2 | 5′-CGCGGATCCAATTAATAATTTGTTTTTATGAGTAAAGGAGAAG-3′ |
| RBSM3 | 5′-CGCGGATCCAATTAATAATTATTATTTATGAGTAAAGGAGAAG-3′ |
| RBSM4 | 5′-CGCGGATCCAATTAATAATTTTTATTTATGAGTAAAGGAGAAG-3′ |
| RBSM5 | 5′-CGCGGATCCAATTAATAATTTTTTTTTATGAGTAAAGGAGAAG-3′ |
| RBSM6 | 5′-CGCGGATCCAATTAATAATTGATATTTATGAGTAAAGGAGAAG-3′ |
| RBSM7 | 5′-CGCGGATCCAATTAATAATTAATGTTTATGAGTAAAGGAGAAG-3′ |
| RBSM8 | 5′-CGCGGATCCAATTAATAATTAAAATTTATGAGTAAAGGAGAAG-3′ |
| RBSM9 | 5′-CGCGGATCCAATTAATAATTAGTATTTATGAGTAAAGGAGAAG-3′ |
| WT | 5′-CGCGGATCCAATTAATAATTAATATTTATGAGTAAAGGAGAAG-3′ |
| SCH08race | 5′-CCGCTCTGCCTCTTGCTCCAGGTCTTG-3′ |
| SCH13race | 5′-CCACATTGAAGTGTAAGCTGCCTGAACAGCTGC-3′ |
| SCH17race | 5′-GTCAATAAGTTCGTCTTTGTTAGCAGGCC-3′ |
| SCH36race | 5′-TGGCATTTGGATTGGATTACCCGTTCC-3′ |
| SCH40race | 5′-GTCTACTTCTCCCCAAACCGGTTTCCATG-3′ |
| SCH41race | 5′-GTAAGTAGCATCACCTTCACCTTCACCGG-3′ |
| SCH52race | 5′-CAACGCTTCGTACCCGTCAACACCTTTGG-3′ |
a
Restriction sites on the primers are underlined.