Skip to main content
. 2006 Dec 15;92(6):2080–2089. doi: 10.1529/biophysj.106.092320

TABLE 1.

Amino acid sequence alignment of the fragment 158–173 for the different species

PDB ID Species 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173
1QLX Human Y P N Q V Y Y R P M D E Y S N Q N
1AG2 Mouse Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N
1B10 Hamster Y P N Q V Y Y R P V D Q Y N N Q N
1DWY Bovine Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N
1UW3 Sheep Y P N Q V Y Y R P V D R Y S N Q N
1XYJ Cat Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N
1XYQ Pig Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N
1XYW Elk Y P N Q V Y Y R P V D Q Y N N Q N
1XYK Dog Y P N Q V Y Y R P V D Q Y N N Q S
1XU0 Frog M P N R V Y R P M Y R G E E Y V
1U3M Chicken Y P N R V Y Y R D Y S S P V P
1U5L Turtle Y P N R V Y Y K E Y N D R S V P

The table shows NMR determined structures deposited in the PDB. It uses human sequence numbering with flanking proline residues underlined and β-sheet assigned structure consisting of amino acid residues. VYY is highlighted in bold.