Table 4.
Nested models for traits LNCIGP and ntth1
| Trait | Log-likelihood | σ2g | σ2e | σ2ef | σ2em | σ2mt | σ2Xf |
| LNCIGP | |||||||
| A-polygenic | -1048.50 | 0.54 | 1.53 | -- | -- | -- | -- |
| B-A+ diff σ2e | -1047.28 | 0.52 | --a | 1.66 | 1.40 | -- | -- |
| C-all parameters | -1045.51 | 0.35 | -- | 1.72 | 1.44 | 0.15 | 0.00 |
| D-eq. σ2e | -1046.91 | 0.36 | 1.58 | -- | -- | 0.15 | 0.00 |
| E-σ2mt = 0 | -1047.24 | 0.49 | -- | 1.67 | 1.38 | -- | 0.03 |
| F-σ2xf = 0 | -1045.51 | 0.34 | -- | 1.72 | 1.44 | 0.15 | -- |
| ntth1 | |||||||
| A-polygenic | 224.36 | 0.07 | 0.15 | -- | -- | -- | -- |
| B-A+ diff σ2e | 227.06 | 0.07 | -- | 0.17 | 0.13 | -- | -- |
| C-all parameters | 229.40 | 0.02 | -- | 0.19 | 0.12 | 0.01 | 0.03 |
| D-eq. σ2e | 225.33 | 0.05 | 0.16 | -- | -- | 0.02 | 0.00 |
| E-σ2mt = 0 | 229.14 | 0.02 | -- | 0.19 | 0.11 | -- | 0.03 |
| F-σ2xf = 0 | 228.27 | 0.04 | -- | 0.18 | 0.13 | 0.02 | -- |
| G-A + σ2mt | 225.33 | 0.05 | 0.16 | -- | -- | 0.02 | -- |
| H-A + σ2xf | 224.37 | 0.07 | 0.15 | -- | -- | -- | 0.00 |
a--, parameter not estimated.