Table 2.
Gene (size of PCR product) | To detect mutation(s) | Forward primer | Reverse primer | |
---|---|---|---|---|
10× Primer mix 1 | ||||
Cx26 (286 bp) | W24X, 35delG, M34T, V37I | 5′-TCTTTTCCAGAGCAAACCGC-3′ | 5′-GsAsCsAsCsGAAGATCAGCTGCA-3′ | |
MtDNA 12 S RNA (137 bp) | A1555G | 5′-CGTCACCCTCCTCAAGTATACTTC-3′ (2 μmol/L) | 5′-GsCsTsTsTsGTGTTAAGCTACACTCTGG-3′ (2 μmol/L) | |
10× Primer mix 2 | ||||
SLC26A4 (249 bp) | L236P | 5′-GGTTTCTATCTCAGGCAAACAT-3′ | 5′-AsTsTsGsTsTTCTGGAATGAACAGTGACC-3′ | |
SLC26A4 (139 bp) | IVS8 + 1G>A | 5′-TTCAGACGATAATTGCTACTG-3′ | 5′-GsAsCsTsGsACTTACTGACTTAATG-3′ | |
SLC26A4 (215 bp) | E384G, T416P | 5′-GTAGGATCGTTGTCATCCAG-3′ | 5′-CsGsAsGsCsCTTCCTCTGTTGC-3′ | |
10× Primer mix 3 | ||||
GJB2 (311 bp) | L90P, R143W, 167delT, 235delC, 313del14 | 5′-CTGCAGCTGATCTTCGTGTC-3′ | 5′-AsCsAsAsAsGCAGTCCACAGTGTT-3′ | |
USH2A (159 bp) | 2299delG | 5′-ATGTGAGCCCTGCCAGTGTA-3′ | 5′-TsCsAsCsAsGGCCTTACAATTGGTG-3′ |
The 10× primer mixes are 4 μmol/L of each primer unless indicated. s, phosphorothioate bond.