Table 5.
Specific genes expressed in the brain
| Tissues from GEO and accession number | |||||||||||||||||||||||||
| Tag | Testis | Prostate | Ovary | Mammary gland | Uterus | Vagina | Skin | Liver | Adipose tissue | Lung | Bone | Skeletal muscle | Cerebral cortex | Hypothalamus | Pituitary gland | Mouse embryonic fibroblasts GSM7759 | Heart normal GSM106587 | Thymus normal GSM106596 | Bladder normal GSM106599 | Kidney normal GSM56242 | Spleen normal GSM106591 | Pancreas Normal GSM106592 | Intestine UniGene and EST expression (%) | Description [UniGene cluster, GenBank Accession No] | General function |
| Cerebral cortex | |||||||||||||||||||||||||
| GTCGTCCTCTA | 2a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 1a | 0a | 0a | 47 | 0a | 0a | 0a | 1a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0 | solute carrier family 17 (sodium-dependent inorganic phosphate cotransporter), member 7 [Mm.255631, NM_182993] | Transport |
| TGACCTTGGCC | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 41 | 1a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0 | gene model 748, (NCBI) [Mm.102203, AK122363] | Protein binding and heme Binding |
| GTACTTGGCTG | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 24 | 1a | 2a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0 | synaptic vesicle glycoprotein 2 b [Mm.273082, NM_153579] | Transporter activity |
| Hypothalamus | |||||||||||||||||||||||||
| TTGGCAAGTCT | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 198 | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0 | RIKEN cDNA A230109K 23 gene [Mm.200361, BC048534] | neurotransmitter or neuromodulator |
| TGTGACGCTGG | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 1a | 0a | 0a | 0a | 0a | 1a | 37 | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0 | cocaine and amphetamine regulated transcript [Mm.75498, NM_013732] | Cell signaling |
| AGTTCCTTCGC | 0a | 1a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 1a | 34 | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0 | calbindin 2 [Mm.2755, NM_007586] | Calciunion binding |
| GGCCGCCGCGC | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 1a | 33 | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0 | hypocretin [Mm.10096, NM_010410] | Cell signaling |
| Pituitary gland | |||||||||||||||||||||||||
| AAGTGTCGCCG | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 14963 | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0 | growth horm one [Mm.343934, NM_008117] | Cell signaling |
| GGCGAGCTGAT | 0a | 0a | 0a | 0a | 1a | 0a | 0a | 1a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 1496 | 0a | 1a | 0a | 0a | 2a | 0a | 0a | 0 | Pro-opiomelanocortin-alpha [Mm.277996, NM_008895] | Cell signaling |
| GCGGGAAAAGC | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 1a | 1383 | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | NM | Novel transcript | |
| CTTGGGTGCAA | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 1307 | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | prolactin [Mm.1270, NM_011164] | Cell signaling | |
| AAGTGTCGCCT | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 601 | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | NM | Novel transcript | |
| TTGGCGTCAAA | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 436 | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | NM | Novel transcript | |
| AAGTGTCGCCA | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 408 | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | NM | Novel transcript | |
| TCGGTTCTCTG | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 329 | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | NM | Novel transcript | |
| ACGTACTTCCG | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 1a | 222 | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | NM | Novel transcript | |
| CGCAGCGACGA | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 218 | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | NM | Novel transcript | |
| GCTGGGGCCCG | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 194 | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | NM | Novel transcript | |
| ACCCGCAGGTA | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 114 | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | NM | Novel transcript | |
| GTCCGAGTACT | 2a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 1a | 0a | 0a | 0a | 0a | 75 | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0 | luteinizing hormone beta [Mm.57061, NM_008497] | Cell signaling |
| TTACTCCTTAT | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 49 | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0a | 0 | thyroid stimulating hormone, beta subunit [Mm.110730, NM_009432] | Thyroid structure and metabolism |
a Significant difference vs. no. of tags shown in bold (p < 0,05)