Table 3.
Fraction of bases involved in various couplings for potential human p53REs without a spacer (insertion) between the two half-sites
H-coupling only | T-coupling only | Q-coupling only | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
No | Con | A | T | C | G | Sum | A | T | C | G | A | T | C | G |
1 | A/G | 0.245 | 0.006 | 0.005 | 0.068 | 0.323 | 0.086 | 0.012 | 0.009 | 0.178 | 0.104 | 0.009 | 0.006 | 0.066 |
2 | A/G | 0.095 | 0.004 | 0.003 | 0.492 | 0.594 | 0.090 | 0.005 | 0.001 | 0.096 | 0.097 | 0.006 | 0.004 | 0.086 |
3 | A/G | 0.089 | 0.004 | 0.004 | 0.458 | 0.555 | 0.079 | 0.000 | 0.013 | 0.199 | 0.074 | 0.003 | 0.004 | 0.203 |
4 | C | 0.000 | 0.000 | 0.002 | 0.000 | 0.002 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.002 | 0.000 |
5 | A/T | 0.148 | 0.062 | 0.000 | 0.000 | 0.210 | 0.130 | 0.094 | 0.001 | 0.000 | 0.128 | 0.067 | 0.000 | 0.000 |
6 | A/T | 0.097 | 0.130 | 0.000 | 0.000 | 0.227 | 0.088 | 0.165 | 0.000 | 0.000 | 0.067 | 0.128 | 0.000 | 0.000 |
7 | G | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.001 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.003 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.002 |
8 | T/C | 0.000 | 0.077 | 0.097 | 0.004 | 0.178 | 0.003 | 0.087 | 0.213 | 0.010 | 0.003 | 0.074 | 0.203 | 0.004 |
9 | T/C | 0.006 | 0.085 | 0.091 | 0.004 | 0.186 | 0.007 | 0.092 | 0.080 | 0.004 | 0.006 | 0.097 | 0.086 | 0.004 |
10 | T/C | 0.007 | 0.043 | 0.018 | 0.008 | 0.076 | 0.013 | 0.098 | 0.223 | 0.006 | 0.009 | 0.104 | 0.066 | 0.006 |
11 | A/G | 0.043 | 0.007 | 0.008 | 0.018 | 0.076 | 0.086 | 0.012 | 0.009 | 0.178 | 0.099 | 0.010 | 0.007 | 0.069 |
12 | A/G | 0.085 | 0.006 | 0.004 | 0.091 | 0.186 | 0.090 | 0.005 | 0.001 | 0.096 | 0.087 | 0.004 | 0.001 | 0.080 |
13 | A/G | 0.077 | 0.000 | 0.004 | 0.097 | 0.178 | 0.079 | 0.000 | 0.013 | 0.199 | 0.087 | 0.000 | 0.003 | 0.186 |
14 | C | 0.000 | 0.000 | 0.001 | 0.000 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.001 | 0.000 |
15 | A/T | 0.130 | 0.097 | 0.000 | 0.000 | 0.227 | 0.130 | 0.094 | 0.001 | 0.000 | 0.114 | 0.055 | 0.000 | 0.000 |
16 | A/T | 0.062 | 0.148 | 0.000 | 0.000 | 0.210 | 0.088 | 0.165 | 0.000 | 0.000 | 0.055 | 0.114 | 0.000 | 0.000 |
17 | G | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.002 | 0.002 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.003 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.001 |
18 | T/C | 0.004 | 0.089 | 0.458 | 0.004 | 0.555 | 0.003 | 0.087 | 0.213 | 0.010 | 0.000 | 0.087 | 0.186 | 0.003 |
19 | T/C | 0.004 | 0.095 | 0.492 | 0.003 | 0.594 | 0.007 | 0.092 | 0.080 | 0.004 | 0.004 | 0.087 | 0.080 | 0.001 |
20 | T/C | 0.006 | 0.245 | 0.068 | 0.005 | 0.323 | 0.013 | 0.098 | 0.223 | 0.006 | 0.010 | 0.099 | 0.069 | 0.007 |