Skip to main content
. 2007 Apr 16;35(9):2986–3001. doi: 10.1093/nar/gkm192

Table 3.

Fraction of bases involved in various couplings for potential human p53REs without a spacer (insertion) between the two half-sites

H-coupling only T-coupling only Q-coupling only



No Con A T C G Sum A T C G A T C G
1 A/G 0.245 0.006 0.005 0.068 0.323 0.086 0.012 0.009 0.178 0.104 0.009 0.006 0.066
2 A/G 0.095 0.004 0.003 0.492 0.594 0.090 0.005 0.001 0.096 0.097 0.006 0.004 0.086
3 A/G 0.089 0.004 0.004 0.458 0.555 0.079 0.000 0.013 0.199 0.074 0.003 0.004 0.203
4 C 0.000 0.000 0.002 0.000 0.002 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.002 0.000
5 A/T 0.148 0.062 0.000 0.000 0.210 0.130 0.094 0.001 0.000 0.128 0.067 0.000 0.000
6 A/T 0.097 0.130 0.000 0.000 0.227 0.088 0.165 0.000 0.000 0.067 0.128 0.000 0.000
7 G 0.000 0.000 0.000 0.001 0.001 0.000 0.000 0.000 0.003 0.000 0.000 0.000 0.002
8 T/C 0.000 0.077 0.097 0.004 0.178 0.003 0.087 0.213 0.010 0.003 0.074 0.203 0.004
9 T/C 0.006 0.085 0.091 0.004 0.186 0.007 0.092 0.080 0.004 0.006 0.097 0.086 0.004
10 T/C 0.007 0.043 0.018 0.008 0.076 0.013 0.098 0.223 0.006 0.009 0.104 0.066 0.006
11 A/G 0.043 0.007 0.008 0.018 0.076 0.086 0.012 0.009 0.178 0.099 0.010 0.007 0.069
12 A/G 0.085 0.006 0.004 0.091 0.186 0.090 0.005 0.001 0.096 0.087 0.004 0.001 0.080
13 A/G 0.077 0.000 0.004 0.097 0.178 0.079 0.000 0.013 0.199 0.087 0.000 0.003 0.186
14 C 0.000 0.000 0.001 0.000 0.001 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.001 0.000
15 A/T 0.130 0.097 0.000 0.000 0.227 0.130 0.094 0.001 0.000 0.114 0.055 0.000 0.000
16 A/T 0.062 0.148 0.000 0.000 0.210 0.088 0.165 0.000 0.000 0.055 0.114 0.000 0.000
17 G 0.000 0.000 0.000 0.002 0.002 0.000 0.000 0.000 0.003 0.000 0.000 0.000 0.001
18 T/C 0.004 0.089 0.458 0.004 0.555 0.003 0.087 0.213 0.010 0.000 0.087 0.186 0.003
19 T/C 0.004 0.095 0.492 0.003 0.594 0.007 0.092 0.080 0.004 0.004 0.087 0.080 0.001
20 T/C 0.006 0.245 0.068 0.005 0.323 0.013 0.098 0.223 0.006 0.010 0.099 0.069 0.007