Table 3.

Tags mapping to HPV16 genome.

Tag	Strand	Gene	N1 tpm	N2 tpm	C1 tpm	C2 tpm
CATGCACGCTTTTTAATTACA	+	E5	0	0	290	1,180
CATGCAACATAAATAAACTTA	+	-	0	0	6	770
CATGGCATTGGACAGGACATA	+	E2	0	0	6	240
CATGTGTATGTATTAAAAATA	-	E5	0	0	6	155
CATGACACAATAGTTACACAA	+	-	0	0	6	125
CATGGGGAGGAATATGATTTA	+	L1/L2	0	0	0	30
CATGTAGACGACACTGCAGTA	-	E2	0	0	0	20
CATGGTAGATTATGGTTTCTG	-	E7	0	0	6	7
CATGTCGTAGGTACTCCTTAA	-	L1/L2	0	0	0	7
CATGGGGATCCTTTGCCCCAG	-	L1/L2	0	0	0	7
CATGATAATATATGTTTGTGC	-	L1/L2	0	0	0	7
CATGCGCCTAGAATGTGCTAT	+	E2	0	0	0	0