Table 1.

Genes Expressed at Higher Levels in the Ewing’s Sarcoma Cell Line

Ratio*	Map	Gene	IMAGE no.	Ratio	Map	Gene	IMAGE no.
42.60	13	BRCA2	429238	2.82	12q23–q24	EPS8	665304
37.17	22q12.3–q13.2	SLC16A3	502151	2.78	1	PEF	137353
33.15	17q21	ETV4	430297	2.78	15q21–q22.2	B2M	324872
12.90	11p15.5	IGF2	245330	2.76	1p32–p36	PABPC4	842820
10.65	11p15.5	IGF2	245330	2.74	2p14–p13	UGP2	486436
10.57	1p36.13–p36.12	ID3	756405	2.73	1p31–p22	CYR61	486700
8.65	13q14.3	LCP1	344589	2.71	11q13	GSTP1	774710
8.27	4q28–q32	ANXA5	786680	2.71	4p16	CTBP1	347702
8.03	12p12.3–p12.1	MGST1	768443	2.67	6q22.1–22.3	RPS5P1	376217
7.62	1q21	S100A4	472180	2.65	1q32	MCP	796994
7.17	1p36	CDW52	301723	2.60	15q22.1–q22.33	MAP2K1	309258
7.12	5q31.3–q32	SPARC	324597	2.59	1p13.3	GSTM4	840990
6.64	3p21.3	GPX1	625473	2.58	20q13.31	PCK1	742082
6.58	6	RAB32	472186	2.52	12q23–q24.1	TXNRD1	789376
5.77	11p15.5	IGF2	296448	2.51	5q12.2–q13.3	GTF2H2	345525
5.58	11p15.5	IGF2	296448	2.46	9q13–q21	CDC20	754999
5.41	13q14.3	LCP1	712280	2.43	6q22–q23	LAMA2	471642
5.20	1q22	IFI16	824602	2.42	2	BRE	739993
5.15	22q13.1	LGALS1	376168	2.41	19p13.3–p13.2	ICAM1	293413
5.10	8q24	PLEC1	781362	2.39	2p22–p21	CAD	274638
4.83	15	LOC56851	110503	2.36	19p13.3	BSG	756533
4.72	Unknown	PTPN9	342927	2.35	8	ADE2H1	273546
4.54	16q22.1	CBFB	322494	2.34	22q13.2	ST13	210887
4.49	1p36.3–p36.2	ENO1	512247	2.30	11q13	GSTP1	136235
4.32	4q13–q21	IL8	549933	2.30	7p22	PDGFA	435470
4.26	Xq26	FGF13	785796	2.30	1p36.1	CDC42	859586
3.93	22q11.21	UFD1L	80708	2.30	5q12–q13	FOXD1	382564
3.87	19p13.1–p12	PRKCL1	153010	2.29	Unknown	EST	32231
3.82	9	SR-BP1	324210	2.29	15q26.1	IQGAP1	898148
3.79	8q24.12–q24.13	MYC	812965	2.29	17	RPL27	272185
3.75	19	ISYNA1	809508	2.27	6q27	RPS6KA2	22711
3.75	11q22.2–q22.3	CASP4	470160	2.27	13q31.2–q32.3	STK24	773137
3.70	16q13	MT1G	202535	2.27	12q22–q23	IGF1	287327
3.68	8q24.12–q24.13	MYC	812965	2.23	1p31	PDE4B	788136
3.63	6q23.3	CITED2	491565	2.22	3p21	CTNNB1	774754
3.63	10p15.3–p15.2	PFKP	950682	2.22	19p13.1	MYO9B	279085
3.62	6q26	IGF2R	79712	2.20	1p34	AK2	626880
3.61	Xp11.3–p11.23	TIMP1	771755	2.19	22q13.2	ST13	210887
3.60	6p21.3	HLA-DRA	726209	2.17	18p11.31–p11.21	YES1	204634
3.59	17	ITGA3	755402	2.16	17q25	CSNK1D	302527
3.58	11q22.3	MMP1	624924	2.16	8p12–p11	DUSP4	756596
3.54	8	E2F5	809828	2.15	4q24	NFKB1	789357
3.52	11p15.4	LDHA	897567	2.12	7	SYPL	770444
3.50	17	EST	768299	2.11	11	PRO1073	257287
3.42	15q24.3	BCL2A1	814478	2.10	10q22	CAMK2G	366154
3.39	16q22.1	CBFB	624754	2.10	6q21	CCNC	647007
3.29	15q24.3	BCL2A1	814478	2.10	2q36–q37	INPP5D	826405
3.29	8	KIAA0143	530310	2.08	7p12–q21	PHKG1	612224
3.28	13q12–q13	ARPC2	162208	2.07	11q23	CD3E	1130062
3.25	1p34	AK2	45464	2.07	1p34.1	HDAC1	548736
3.24	15	LOC56851	110503	2.06	Xq26	ARHGEF6	687990
3.21	4	KIAA0746	809374	2.06	17q11.2	MAP2K3	45641
3.20	2q37	COL6A3	138991	2.05	12p12.3	ARHGDIB	841332
3.17	4q34–q35	FAT	503119	2.05	3	EST	137984
3.10	1p34	LAPTM5	753313	2.05	6p21.3	DAXX	841498
2.98	6p21.3	HLA-A	853906	2.05	17q25	BIRC5	796694
2.98	3p21.2	IMPDH2	292008	2.05	11q23.2–q23.3	H2AFX	114416
2.94	7q11.23	LIMK1	1086811	2.05	22	SIVA	501643
2.93	17q25	H3F3B	950574	2.04	20p12.1–p11.23	JAG1	141815
2.92	10q22–q23	ANXA11	810117	2.04	20q12	SDC4	504763
2.89	16p13.3	NME4	203003	2.04	8q24	RAD21	383190
2.88	4	UGT2B10	293742	2.03	6q23	SGK	840776
2.88	20pter–p12	PRNP	812048	2.03	8	ADE2H1	273546
2.87	9q33–q34.1	ENG	307887	2.02	19p13.3	KHSRP	123400
2.84	10q25.3	PGAM1	486108	2.01	6pter–q12	NMOR2	824024
2.84	11p15.5	LSP1	1323933	2.01	1q21–q25	TAGLN2	45544
2.83	17	NMT1	756480	2.00	12p13	CCND2	366412
2.82	5q14–q21	PAM	140806	2.00	10q22–q23	ATP5C1	845519

Relative gene expression ratios of Ewing’s sarcoma compared to neuroblastoma.

Map, chromosomal location.

IMAGE, International Molecular Analysis of Genomics and their Expression.