TABLE 2.
Fluoroquinolone susceptibilities of S. oralis and S. mitis and their respective amino acid substitutions at the QRDRs of the gyrase and topoisomerase genesa
Isolate no. | MIC (μg/ml) for:
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Result for efflux phenotype detection | Amino acid substitution at indicated QRDRb
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CIP | LEV |
gyrA
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gyrB
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parC
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parE
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Ser 81 | Ser 114 | Leu 155 | Ile 385 | Met 483 | Ser 494 | Ser 52 | Ser 79 | Asp 83 | Asn 91 | Glu 135 | Pro 140 | Ala 142 | Arg 447 | ||||
S. pneumoniae R6 | 0.5 | 0.5 | - | ||||||||||||||
S. oralis | - | ||||||||||||||||
ATCC 10557 | 2 | 1 | N | Gly | - | Asp | - | ||||||||||
HK575 | 1 | 1 | - | Gly | Val | - | Gly | Asp | Ser | - | |||||||
HK323 | 2 | 1 | P | Gly | - | Gly | Asp | - | |||||||||
HK417 | 2 | 1 | P | Gly | - | Gly | Asp | - | |||||||||
HK496 | 2 | 1 | P | Gly | - | Gly | Asp | - | |||||||||
HK553 | 2 | 1 | P | Gly | - | Gly | Asp | - | |||||||||
HK62 | 4 | 1 | P | Gly | - | Gly | Asp | - | |||||||||
HK122 | 4 | 1 | P | Gly | - | Gly | Asp | - | |||||||||
HK123 | 4 | 1 | P | Gly | - | Gly | Asp | - | |||||||||
HK271 | 4 | 1 | P | Gly | - | Gly | Asp | - | |||||||||
HK300 | 4 | 1 | P | Gly | - | Gly | Asp | - | |||||||||
HK312 | 4 | 1 | P | Gly | - | Gly | Asp | - | |||||||||
HK51 | 4 | 2 | P | Gly | - | Gly | Asp | - | |||||||||
HK299 | 4 | 2 | P | Gly | - | Gly | Asp | - | |||||||||
HK579 | 4 | 2 | P | Gly | - | Gly | Asp | - | |||||||||
HK587 | 4 | 2 | P | Gly | - | Gly | Asp | - | |||||||||
HK386 | 4 | 2 | P | Gly | - | Gly | Asp | - | |||||||||
HK619 | 4 | 2 | P | Gly | - | Gly | Asp | - | |||||||||
HK574 | 8 | 2 | P | Gly | Val | Thr | Thr | Gly | Asp | ||||||||
HK816 | 32 | 32 | N | Leu | Gly | - | Gly | Tyr | Asp | ||||||||
HK754 | 128 | ≥32 | N | Leu | Gly | Thr | Gly | Tyr | Asp | Ser | |||||||
S. mitis | |||||||||||||||||
ATCC 49456 | 1 | 1 | - | Gly | Gly | Asp | Asp | Ser | |||||||||
HK260 | <0.5 | <0.25 | - | Gly | - | Gly | Asp | - | |||||||||
HK141 | 1 | 0.5 | - | Gly | - | Gly | Asp | - | |||||||||
HK188 | 1 | 0.5 | - | Gly | - | Gly | Asp | Asp | - | ||||||||
HK651 | 1 | 0.5 | - | Gly | - | Gly | Asp | - | |||||||||
HK137453 | 2 | 1 | P | Gly | - | Gly | Asp | - | |||||||||
HK680 | 2 | 1 | P | Gly | - | Gly | Asp | ||||||||||
HK125807 | 2 | 1 | P | Gly | - | Gly | Asp | - | |||||||||
HK467 | 2 | 1 | N | Gly | Val | - | Gly | Asp | - | ||||||||
HK666 | 2 | 2 | P | Gly | - | Gly | Asp | Asp | - | ||||||||
HK135786 | 4 | 1 | P | Gly | - | Gly | Asp | - | |||||||||
HK29 | 4 | 2 | P | Gly | - | Gly | Asp | - | |||||||||
HK677 | 128 | ≥32 | N | Leu | Gly | Thr | Gly | Tyr | Asp | - |
P, positive; N, negative; -, not done.
Position of amino acid substitution compared to the corresponding amino acid position of S. pneumoniae R6.