Skip to main content
. 2007 Jun 15;8:173. doi: 10.1186/1471-2164-8-173

Table 5.

Mean frequency, repeat count, and polymorphism by motif length and GC content in microsatellites with two allowed mismatched repeat positions

Length GC content simpfreq compfreq totfreq fracsimp simprepe comprepe simppoly comppoly
3 0 3.226 0.447 3.673 0.882 8.739 9.487 0.189 0.145
0.333 4.822 0.595 5.417 0.905 8.309 9.217 0.163 0.189
0.667 4.037 0.483 4.521 0.896 8.051 8.418 0.172 0.214
1 6.45 0.566 7.017 0.942 7.888 7.817 0.162 0.231
4 0 1.107 0.101 1.208 0.917 5.497 5.513 0.133 0.152
0.25 0.577 0.074 0.651 0.919 5.585 5.878 0.191 0.169
0.5 0.225 0.018 0.244 0.928 5.475 5.772 0.185 0.206
0.75 0.237 0.024 0.262 0.909 5.504 5.578 0.174 0.176
1 0.14 0.015 0.156 0.899 5.224 5.109 0.201 0.166
5 0 0.763 0.073 0.836 0.918 4.188 4.283 0.129 0.144
0.2 0.314 0.035 0.348 0.925 4.276 4.333 0.176 0.185
0.4 0.14 0.014 0.154 0.925 4.318 4.507 0.167 0.245
0.6 0.11 0.009 0.119 0.939 4.341 3.825 0.19 0.142
0.8 0.109 0.013 0.121 0.939 4.242 3.99 0.178 0.207
1 0.143 0.022 0.165 0.879 4.12 4.299 0.168 0.137
6 0 0.101 0.016 0.117 0.878 4.213 4.385 0.148 0.165
0.167 0.06 0.008 0.069 0.867 4.167 3.86 0.168 0.116
0.333 0.042 0.006 0.048 0.889 4.19 3.392 0.195 0.115
0.5 0.058 0.009 0.067 0.9 4.323 3.682 0.234 0.164
0.667 0.056 0.01 0.067 0.839 4.103 3.846 0.206 0.19
0.833 0.104 0.014 0.118 0.897 4.261 4.23 0.188 0.207
1 0.102 0.01 0.112 0.916 4.137 3.57 0.143 0.219