TABLE 2.
Marker locus | Motif | Period (bp) | Primer sequence
|
Total no. of variants | |
---|---|---|---|---|---|
Forward | Reverse | ||||
V2A | TCTCAC | 6 | CAGCGCTTCTTTATTTGCTGC | GCGTTATCTACCTGATGGTGC | 14 |
V4 | CGGCAAC | 7 | GTCACATTGGCCTTAATCACC | TCGTACTCAATTTCCTGATGC | 8 |
V5 | GGTGCA | 6 | ACAGTTATTGCAAGAGATGGG | AACTGGTTGAACTAGAACACC | 15 |
V6 | GACTCA | 6 | ATTGCTCTGCGGTGTATTACG | CTTCTCGGCGATCCAGAAGCC | 12 |
V7 | GTGCTG | 6 | CCATAATCTAGACCTCTTTGG | AGAATTCGTTGGCCTGTTTGG | 14 |
V9 | ATGTCGGTAGAA | 12 | AGGGTATTCATGCACAGAAGC | ATGGCTAAAATACGTTCAGCC | 7 |
V10 | GTTCTGGT | 8 | TTATCTAAGTGCAGGACGGAG | TTGGTTCATCGGAGGTTAAGC | 13 |