Table 1.
Primers used for gene amplification
Gene | Primer | Sequence |
---|---|---|
rpoD (σ70 gene) | D1 | 5′-CCCAAGCTTGAATTCATGGAGCAAAACCCGCAGTCAC-3′ |
D4 | 5′-CCCAAGCTTGTCGACTTAATCGTCCAGGAAGCTACG-3′ | |
rpoN (σ54 gene) | N1 | 5′-GGAATTCCATATGAAGCAAGGTTTGCAACTCAGG-3′ |
N2 | 5′-CATGCATGCCTCGAGTCAAACGAGTTGTTTACGCTG-3′ | |
rpoS (σ38 gene) | S5 | 5′-GCGAATTCCATATGTTCCGTCAAGGGATCACG-3′ |
S6 | 5′-GCGGATCCCTCGAGTTACTCGCGGAACAGCGCTTC-3′ | |
rpoF (σ28 gene) | F1 | 5′-CGAGCTCGGATCCCCATGAATTCACTCTATACCGCT-3′ |
F2 | 5′-GGGGTACCCTCGAGTTATAACTTACCCAGTTTAGT-3′ | |
flgM (FlgM gene) | M1 | 5′-GCGAATTCCATATGAGTATTGATCGCACTTCGCC-3′ |
M2 | 5′-GCGGATCCCTCGAGGTTACTCTGCAAGTCTTGCTG-3′ | |
rsd (Rsd gene) | RsdU | 5′-GCGAATTCCATATGCTTAACCAGCTCGATAACC-3′ |
RsdR | 5′-AACTGCAGCTCGAGAGCAGGATGTTTGACGCGGGC-3′ |