TABLE 3.
Strains that produced discrepant identifications by conventional methods and array hybridization
| Strain | Species identification when received | Species identification(s) by:
|
Result of discrepant analysis | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Array | ITS-1/ITS-2 sequence (% ITS-1/% ITS-2)a | D1-D2 sequence (%)a | |||
| Target strains | |||||
| LMA 597 | M. audouinii | NIb | M. audouinii (100/99) | M. audouinii (100) | M. audouinii |
| LMA 922 | M. canis | NI | NI | NI | NI |
| M. canis (42/46) | |||||
| LMA 90603 | M. gypseum | NI | M. fulvum (99/99) | M. fulvum (99) | M. fulvum |
| M. gypseum (87/94) | M. gypseum (99) | ||||
| LMA 951682 | T. mentagrophytes var. interdigitale | NI | NI | NI | NI |
| T. mentagrophytes (56/57) | |||||
| LMA 831 | T. soudanense | T. violaceum | T. violaceum (97/100) | T. violaceum (99) | T. violaceum |
| T. soudanense (96/100) | |||||
| LMA 835 | T. soudanense | T. violaceum | T. violaceum (97/100) | T. violaceum (99) | T. violaceum |
| T. soudanense (97/100) | |||||
| LMA 979 | T. soudanense | T. violaceum | T. violaceum (100/99) | T. violaceum (99) | T. violaceum |
| T. soudanense (98/99) | |||||
| LMA 951336 | T. soudanense | T. tonsurans | T. tonsurans (99/100) | T. tonsurans (100) | T. tonsurans |
| T. soudanense (77/81) | |||||
| LMA 50500944 | T. soudanense | T. violaceum | T. violaceum (99/100) | T. violaceum (99) | T. violaceum |
| T. soudanense (96/100) | |||||
| LMA 50600067 | T. soudanense | T. violaceum | T. violaceum (100/99) | T. violaceum (99) | T. violaceum |
| T. soudanense (98/100) | |||||
| NCKU 3156 | T. tonsurans | T. rubrum | T. rubrum (100/100) | T. rubrum (100) | T. rubrum |
| T. tonsurans (79/80) | |||||
| LMA 40204990 | T. verrucosum | T. rubrum | T. rubrum (100/100) | T. rubrum (100) | T. rubrum |
| T. verrucosum (87/93) | |||||
| LMA 50200673 | T. verrucosum | T. rubrum | T. rubrum (100/100) | T. rubrum (100) | T. rubrum |
| T. verrucosum (87/93) | |||||
| Nontarget strains | |||||
| CBS 170.65 | T. gourvilii var. intermedium | T. soudanense | T. gourvilii (97/99) | T. gourvilii (100) | T. gourvilii |
| T. soudanense (97/98) | |||||
| LMA 40396666 | M. equinum | M. canis | M. canis (100/100) | M. canis (99.8) | M. canis/M. equinum |
| M. equinum (100/100)a | |||||
a
Results of BLAST search in GenBank.
b
NI, not identified.